RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577256.5

ATG13-223, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 4

Gene ATG13, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-223	ENST00000577256	SPCS2	Q15005	226 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	RAX2	Q96IS3	184 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM68	Q96MH6	324 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	WIPF1	O43516	503 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	RCVRN	P35243	200 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	CATR1	Q13166	79 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	PRSS8	Q16651	343 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM17	Q86X19	198 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	MOB3A	Q96BX8	217 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	TNFSF12	O43508	249 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	HLA-DMA	P28067	261 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	HRH1	P35367	487 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	RUNX1	Q01196	453 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	DEFB136	Q30KP8	78 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	DUX3	Q96PT4	197 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	SCOC	Q9UIL1	159 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	RGS5	O15539	181 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	ACTL6B	O94805	426 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	HRAS	P01112	189 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	TNXA	Q16473	311 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	MMD2	Q8IY49	270 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	GPHA2	Q96T91	129 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	GNB4	Q9HAV0	340 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256		H3BUA1	57 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256		I3L521	148 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	GNRHR	P30968	328 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	RAB25	P57735	213 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	TSPAN5	P62079	268 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	FHL3	Q13643	280 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	POC5	Q8NA72	575 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	OR11H1	Q8NG94	326 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	PHB2	Q99623	299 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	OR2A4	O95047	310 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	TPPP2	P59282	170 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	REC114	Q7Z4M0	266 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	ISOC1	Q96CN7	298 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	RHOV	Q96L33	236 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	OR2A7	Q96R45	310 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	MSGN1	A6NI15	193 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256		H3BMQ9	156 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	CTDSP2	O14595	271 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	RAMP3	O60896	148 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	KBTBD11	O94819	623 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	TRGV3	P03979	118 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	OR8U8	P0C7N1	319 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF616	Q08AN1	781 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	LAX1	Q8IWV1	398 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	OR5T1	Q8NG75	326 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	OR51H1	Q8NH63	302 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	OR52I2	Q8NH67	350 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	DPF1	Q92782	380 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	MS4A10	Q96PG2	267 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	OR5B12	Q96R08	314 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	ABHD1	Q96SE0	405 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	SPIN2A	Q99865	258 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		13.68	□□□□□ -0.22

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