RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 IGHV3-7P01780 117 aa15.39■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 HBE1P02100 147 aa15.39■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 LINC00205P59089 165 aa15.39■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 RPP30P78346 268 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 OR52E5Q8NH55 327 aa15.39■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 LINC01560Q8TB33 94 aa15.39■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 LEAP2Q969E1 77 aa15.39■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 SMDT1Q9H4I9 107 aa15.39■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 KPTNQ9Y664 436 aa15.39■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 J3QKU1 62 aa15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 H2AFB1P0C5Y9 115 aa15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 GNG10P50151 68 aa15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 SPCS3P61009 180 aa15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 ARL16Q0P5N6 197 aa15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 OR4C12Q96R67 309 aa15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 TMEM147Q9BVK8 224 aa15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 HIPK2Q9H2X6 1198 aa15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 KAAG1Q9UBP8 84 aa15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 OR9G9P0C7N8 305 aa15.37■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 SERF2P84101 59 aa15.37■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 OR8G2PQ6IF36 304 aa15.37■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 ATRAIDQ6UW56 229 aa15.37■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 HEPN1Q6WQI6 88 aa15.37■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 TIMM9Q9Y5J7 89 aa15.37■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 A0A1W2PPE3 182 aa15.37■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 IFNA17P01571 189 aa15.37■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 HFEQ30201 348 aa15.37■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 OR10P1Q8NGE3 313 aa15.37■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF251Q9BRH9 671 aa15.37■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 FBXO7Q9Y3I1 522 aa15.37■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 C19orf84I3L1E1 186 aa15.36■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 HRASP01112 189 aa15.36■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 IGFBP2P18065 325 aa15.36■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF273Q14593 569 aa15.36■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 GUCA2BQ16661 112 aa15.36■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 RTL8BQ17RB0 113 aa15.36■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 MUC15Q8N387 334 aa15.36■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 TMEM140Q9NV12 185 aa15.36■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 ROS1P08922 2347 aa15.36■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 USF3Q68DE3 2245 aa15.35■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 DCHS2Q6V1P9 2916 aa15.35■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa15.35■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 FAM157AC9JC47 383 aa15.35■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 OR2B8PP59922 312 aa15.35■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP15.35■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 ZDHHC16Q969W1 377 aa15.35■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 AIFM2Q9BRQ8 373 aa15.35■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 KIAA1456Q9P272 454 aa15.35■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 RFNGQ9Y644 331 aa15.35■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 ABCA4P78363 2273 aa15.35■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 FSTL3O95633 263 aa15.34■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 PPOXP50336 477 aa15.34■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 GNB2P62879 340 aa15.34■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 POU2AF1Q16633 256 aa15.34■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 SSX9Q7RTT3 188 aa15.34■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF429Q86V71 674 aa15.34■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 C8orf31Q8N9H6 132 aa15.34■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 RSG1Q9BU20 258 aa15.34■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa15.34■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 MMP23AO75900 390 aa15.34■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 PLAUP00749 431 aa15.34■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 PPT1P50897 306 aa15.34■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 RELBQ01201 579 aa15.34■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 UTF1Q5T230 341 aa15.34■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 TMEM200BQ69YZ2 307 aa15.34■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF383Q8NA42 475 aa15.34■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 SCRT1Q9BWW7 348 aa15.34■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
SPNS3-204ENST00000575194 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa15.33■□□□□ 0.04
SPNS3-204ENST00000575194 C15orf61A6NNL5 157 aa15.33■□□□□ 0.04
SPNS3-204ENST00000575194 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
SPNS3-204ENST00000575194 DVL1O14640 695 aa15.33■□□□□ 0.04
SPNS3-204ENST00000575194 ARG1P05089 322 aa15.33■□□□□ 0.04
SPNS3-204ENST00000575194 VWC2Q2TAL6 325 aa15.33■□□□□ 0.04
SPNS3-204ENST00000575194 TMEM41BQ5BJD5 291 aa15.33■□□□□ 0.04
SPNS3-204ENST00000575194 FAM71F2Q6NXP2 309 aa15.33■□□□□ 0.04
SPNS3-204ENST00000575194 SPSB3Q6PJ21 355 aa15.33■□□□□ 0.04
SPNS3-204ENST00000575194 LYPD2Q6UXB3 125 aa15.33■□□□□ 0.04
SPNS3-204ENST00000575194 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa15.33■□□□□ 0.04
SPNS3-204ENST00000575194 TMEM204Q9BSN7 226 aa15.33■□□□□ 0.04
SPNS3-204ENST00000575194 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
SPNS3-204ENST00000575194 PMS2P5A8MQ11 134 aa15.32■□□□□ 0.04
SPNS3-204ENST00000575194 GPR37O15354 613 aa15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms