RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566243.5

EDC3-211, Transcript of enhancer of mRNA decapping 3, humanhuman

TSL 3

Gene EDC3, Length 711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3-211ENST00000566243 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
EDC3-211ENST00000566243 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa14.84□□□□□ -0.03
EDC3-211ENST00000566243 EXTL2Q9UBQ6 330 aa14.84□□□□□ -0.03
EDC3-211ENST00000566243 ADAM30Q9UKF2 790 aa14.84□□□□□ -0.03
EDC3-211ENST00000566243 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
EDC3-211ENST00000566243 CNIH1O95406 144 aa14.83□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 HRH1P35367 487 aa14.83□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 PRSS8Q16651 343 aa14.83□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 ACTBL2Q562R1 376 aa14.83□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 ASPHD1Q5U4P2 390 aa14.83□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa14.83□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 ZBTB34Q8NCN2 500 aa14.83□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa14.83□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 OR5B12Q96R08 314 aa14.83□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 BCL7BQ9BQE9 202 aa14.83□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 SULT1C2O00338 296 aa14.82□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 CTDSP2O14595 271 aa14.82□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 PLXNB1O43157 2135 aa14.82□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 GNRHRP30968 328 aa14.82□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 HERV-K104P61576 105 aa14.82□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 LAX1Q8IWV1 398 aa14.82□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 OR4S2Q8NH73 311 aa14.82□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 MOB3AQ96BX8 217 aa14.82□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 ABHD1Q96SE0 405 aa14.82□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 FXYD6Q9H0Q3 95 aa14.82□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 VSIG4Q9Y279 399 aa14.82□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 DNAH3Q8TD57 4116 aa14.81□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 H3BMQ9 156 aa14.81□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 I3L521 148 aa14.81□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 RAMP3O60896 148 aa14.81□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 RCVRNP35243 200 aa14.81□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 OR5M8Q8NGP6 311 aa14.81□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 ISOC1Q96CN7 298 aa14.81□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 MS4A10Q96PG2 267 aa14.81□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 RUNX1Q01196 453 aa14.8□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 FHL3Q13643 280 aa14.8□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 TNXAQ16473 311 aa14.8□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 FOXB2Q5VYV0 432 aa14.8□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 PYHIN1Q6K0P9 492 aa14.8□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 SPAG16Q8N0X2 631 aa14.8□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 OR5T1Q8NG75 326 aa14.8□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 OR6F1Q8NGZ6 308 aa14.8□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 OR52I2Q8NH67 350 aa14.8□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 KLK11Q9UBX7 282 aa14.8□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 MSGN1A6NI15 193 aa14.79□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 RGS5O15539 181 aa14.79□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 APELAP0DMC3 54 aa14.79□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 KIR2DS2P43631 304 aa14.79□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 RAB25P57735 213 aa14.79□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 C10orf55Q5SWW7 151 aa14.79□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 POC5Q8NA72 575 aa14.79□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 OR11H1Q8NG94 326 aa14.79□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 OR51H1Q8NH63 302 aa14.79□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 SCOCQ9UIL1 159 aa14.79□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 CEPT1Q9Y6K0 416 aa14.79□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 TPPPO94811 219 aa14.78□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 CATR1Q13166 79 aa14.78□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 OR1N2Q8NGR9 330 aa14.78□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
EDC3-211ENST00000566243 M0QYG6 137 aa14.77□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 NOL3O60936 208 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 KBTBD11O94819 623 aa14.77□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 OR2A4O95047 310 aa14.77□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 IGHV3-11P01762 117 aa14.77□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 TPPP2P59282 170 aa14.77□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 VAX1Q5SQQ9 334 aa14.77□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 AADACL3Q5VUY0 350 aa14.77□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 SSX9Q7RTT3 188 aa14.77□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 MMD2Q8IY49 270 aa14.77□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa14.77□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 RHOVQ96L33 236 aa14.77□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 TMEM68Q96MH6 324 aa14.77□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 OR2A7Q96R45 310 aa14.77□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 PHB2Q99623 299 aa14.77□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 SLA2Q9H6Q3 261 aa14.77□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 MTFP1Q9UDX5 166 aa14.77□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 HRASP01112 189 aa14.76□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 TRGV3P03979 118 aa14.76□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 RLN1P04808 185 aa14.76□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 CD40LGP29965 261 aa14.76□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 TSPAN5P62079 268 aa14.76□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 DGCR2P98153 550 aa14.76□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 VSTM2AQ8TAG5 236 aa14.76□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 BORCS5Q969J3 196 aa14.76□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
EDC3-211ENST00000566243 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms