RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	PPP5D1	E7EU14	171 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	ITGB1BP1	O14713	200 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	PROP1	O75360	226 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	HRAS	P01112	189 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	EGR1	P18146	543 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	TMPRSS3	P57727	454 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	PFDN5	Q99471	154 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	S1PR3	Q99500	378 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	15.28	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	DKK4	Q9UBT3	224 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	DUSP13	Q9UII6	198 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PPV4	95 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3-13	P01766	116 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	OPRK1	P41145	380 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	RAB7A	P51149	207 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	C4orf17	Q53FE4	359 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559		Q8N7P7	452 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	GAB2	Q9UQC2	676 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RRN3-205	ENST00000563559	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	GYPA	P02724	150 aa		15.26	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	LOXL3	P58215	753 aa		15.26	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	TLE1	Q04724	770 aa		15.26	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	OR4X1	Q8NH49	305 aa		15.26	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		15.26	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		15.26	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		15.26	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	SSX9	Q7RTT3	188 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	OR4S2	Q8NH73	311 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	OR2V2	Q96R30	315 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	HCFC1	P51610	2035 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559		F6UZH7	168 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	CD99	P14209	185 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	FABP4	P15090	132 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	BTF3L4	Q96K17	158 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	CRYAA	P02489	173 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	GLRX	P35754	106 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	EDDM3B	P56851	147 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	RELB	Q01201	579 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	TREML4	Q6UXN2	200 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF383	Q8NA42	475 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	NECAP1	Q8NC96	275 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	CALY	Q9NYX4	217 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	TMPRSS2	O15393	492 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	GFRA3	O60609	400 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	LHB	P01229	141 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF83	P51522	516 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	LRP11	Q86VZ4	500 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB124	Q8NES8	71 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM140	Q9NV12	185 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	CACNA1H	O95180	2353 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	CEACAM4	O75871	244 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	FAM209B	Q5JX69	171 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559		Q8TCH9	128 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	ACY3	Q96HD9	319 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	TYMS	P04818	313 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF134	P52741	427 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	CST9LP1	Q5W188	147 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	DDB2	Q92466	427 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	PRSS46	E5RG02	174 aa		15.22	■□□□□ 0.03

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