RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 OTOSQ8NHW6 89 aa3□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 GHSRQ92847 366 aa3□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 ORAI1Q96D31 301 aa3□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 CYYR1Q96J86 154 aa3□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 PHB2Q99623 299 aa3□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 CGREF1Q99674 301 aa3□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa3□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM14BQ9NUH8 114 aa3□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 GNG12Q9UBI6 72 aa3□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 ACOD1A6NK06 481 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 FAM223BA6NKX1 122 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 SLC22A1O15245 554 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 SPINT2O43291 252 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 APOHP02749 345 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 IGKV1-16P04430 117 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 OR9G9P0C7N8 305 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 CT45A6P0DMU7 189 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 CT45A5P0DMU8 189 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 CT45A7P0DMV0 189 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 GZMHP20718 246 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 BDKRB2P30411 391 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 MC5RP33032 325 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 KDELR2P33947 212 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 DEFB131AP59861 70 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 RELQ04864 619 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 CTF1Q16619 201 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 AGKQ53H12 422 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 RPL39P5Q59GN2 51 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 TTC32Q5I0X7 151 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 ATAD3CQ5T2N8 411 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 FAM222AQ5U5X8 452 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 OR4A47Q6IF82 309 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF497Q6ZNH5 498 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 FAM223AQ8IWN6 122 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 FAM24BQ8N5W8 94 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 CHST4Q8NCG5 386 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 OR8D4Q8NGM9 314 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 CNIH3Q8TBE1 160 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 ASB9Q96DX5 294 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 BTBD10Q9BSF8 475 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 TSPYL1Q9H0U9 437 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 A0A1W2PS18 150 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 TRPC5OSA6NMA1 111 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 KNCNA6PVL3 124 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 FAM90A26D6RGX4 464 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 H0YJW9 148 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 RS1O15537 224 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 SULT1B1O43704 296 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 IGLV2-8P01709 118 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 HBZP02008 142 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 REG1AP05451 166 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 H1F0P07305 194 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 MAGEA2P43356 314 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 RBP2P50120 134 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 HTD2P86397 168 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 STX3Q13277 289 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 CLINT1Q14677 625 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 PIGYQ3MUY2 71 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 MORN2Q502X0 79 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 SLC25A30Q5SVS4 291 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 CST9LP1Q5W188 147 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 SSX9Q7RTT3 188 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 STHQ8IWL8 128 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 SUMF2Q8NBJ7 301 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 DMBX1Q8NFW5 382 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 MARC2Q969Z3 335 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 RNF2Q99496 336 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 GFI1Q99684 422 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 OR51V1Q9H2C8 321 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 KCNK15Q9H427 330 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 NEK6Q9HC98 313 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 SLC2A9Q9NRM0 540 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 MRGBPQ9NV56 204 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 ETV7Q9Y603 341 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa2.97□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa2.97□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa2.97□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 ZSCAN12O43309 604 aa2.97□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
TMOD3-210ENST00000561408 ALOX5APP20292 161 aa2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms