RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560965.1

CHP1-208, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 2

Gene CHP1, Length 467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-208	ENST00000560965	UCP1	P25874	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	CCR6	P51684	374 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	RAB25	P57735	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	SSX2	Q16385	188 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	POU2AF1	Q16633	256 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	TRIM16L	Q309B1	348 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	OR4A5	Q8NH83	315 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	COQ8A	Q8NI60	647 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	UBALD1	Q8TB05	177 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	ASB13	Q8WXK3	278 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	LEAP2	Q969E1	77 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	CYYR1	Q96J86	154 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM56	Q96MV1	263 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	PHB2	Q99623	299 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	NABP2	Q9BQ15	211 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	VSIG4	Q9Y279	399 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965		A0A1W2PPE3	182 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965		H0YJW9	148 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	PROP1	O75360	226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	SFT2D2	O95562	160 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	LY86	O95711	162 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	MOS	P00540	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	SLPI	P03973	132 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	SLC25A6	P12236	298 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	NQO2	P16083	231 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	VDAC1	P21796	283 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	IER3	P46695	156 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	ERVK-16	P61578	105 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	BAMBI	Q13145	260 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	KLRD1	Q13241	179 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	DHRS2	Q13268	280 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965		Q6YL49	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	LYG2	Q86SG7	212 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	LGI3	Q8N145	548 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	NPB	Q8NG41	125 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	MITD1	Q8WV92	249 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	CFHR4	Q92496	578 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	COA4	Q9NYJ1	87 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	RNF150	Q9ULK6	438 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	MTOR	P42345	2549 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965		A0A0U1RQK1	487 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	C9orf170	A2RU37	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	C7orf66	A4D0T2	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	LINC00473	A8K010	186 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	NUDT19	A8MXV4	375 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965		H7C2Y5	167 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	TIMM23	O14925	209 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	FCGR3B	O75015	233 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	CRLF1	O75462	422 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	OR2F2	O95006	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	NDUFA3	O95167	84 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	VENTX	O95231	258 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	IGHV3-7	P01780	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	AKR1C4	P17516	323 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	HLA-G	P17693	338 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	MAS1L	P35410	378 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	UBE2K	P61086	200 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM187	Q14656	261 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHP1-208	ENST00000560965	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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