RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 FAM201AQ5SY85 155 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 TEX36Q5VZQ5 186 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 LCN12Q6JVE5 192 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 ACP7Q6ZNF0 438 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 NAA40Q86UY6 237 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 FAM86B1Q8N7N1 296 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 CYB561A3Q8NBI2 242 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 LY6G5BQ8NDX9 201 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 NPBQ8NG41 125 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 OR10R2Q8NGX6 335 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 OR8S1Q8NH09 359 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 OR4K13Q8NH42 304 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 MYDGFQ969H8 173 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 ITFG2Q969R8 447 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 PYURFQ96I23 114 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 DNTTIP1Q9H147 329 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 C16orf95Q9H693 158 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 TANC2Q9HCD6 1990 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 C5orf63A6NC05 138 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 L7N2F9 121 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 PEX7O00628 323 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 NDUFB3O43676 98 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 ATP6V1G2O95670 118 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 CLIC3O95833 236 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 GYPAP02724 150 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 FBP1P09467 338 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 STAG3L3P0CL85 134 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 IGKV1-13P0DP09 117 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF19P17023 458 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 DCKP27707 260 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 CTRLP40313 264 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 NUDT2P50583 147 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 MNAT1P51948 309 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 PSME3P61289 254 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 ARF6P62330 175 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 ACTA2P62736 377 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 GRB2P62993 217 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 ACTG2P63267 376 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 ACTC1P68032 377 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 ACTA1P68133 377 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 PAX5Q02548 391 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 CLINT1Q14677 625 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC54Q8NEL0 328 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 PROKR2Q8NFJ6 384 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 OR52L1Q8NGH7 329 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF502Q8TBZ5 544 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 P2RX4Q99571 388 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 COPS4Q9BT78 406 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 RGCCQ9H4X1 137 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 ABCB9Q9NP78 766 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 IL20Q9NYY1 176 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 TBC1D24Q9ULP9 559 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 BAIAP2Q9UQB8 552 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 NOTCH3Q9UM47 2321 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 TRAV25A0A0B4J276 109 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF878C9JN71 531 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 ANKRD65E5RJM6 399 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 M0R1W7 72 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 PAHP00439 452 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 MOSP00540 346 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 FABP3P05413 133 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 ELK1P19419 428 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 TGM4P49221 684 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 UBE2E1P51965 193 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 IL5RAQ01344 420 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 GLYATL3Q5SZD4 288 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF826PQ6ZT77 177 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 DCXRQ7Z4W1 244 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 VMO1Q7Z5L0 202 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 C11orf53Q8IXP5 236 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 C19orf18Q8NEA5 215 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 OR1M1Q8NGA1 313 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 OR10Z1Q8NGY1 313 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 OR2AE1Q8NHA4 323 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 LRRC29Q8WV35 223 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 SLAMF6Q96DU3 332 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 MICU1Q9BPX6 476 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 TLNRD1Q9H1K6 362 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 MTCH1Q9NZJ7 389 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-208ENST00000560725 ADA2Q9NZK5 511 aa3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms