RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 AWAT2Q6E213 333 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 MMD2Q8IY49 270 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.96□□□□□ -1.3
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SMAD3-211ENST00000559460 OR14A2Q96R54 314 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.96□□□□□ -1.3
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SMAD3-211ENST00000559460 FAM229AH3BQW9 127 aa6.95□□□□□ -1.3
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SMAD3-211ENST00000559460 GPR148Q8TDV2 347 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 MUL1Q969V5 352 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
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SMAD3-211ENST00000559460 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.95□□□□□ -1.3
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SMAD3-211ENST00000559460 CRYZL1O95825 349 aa6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 SPP1P10451 314 aa6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 PSMD7P51665 324 aa6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 PLA2G7Q13093 441 aa6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 CDK10Q15131 360 aa6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 ACBD7Q8N6N7 88 aa6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 THYN1Q9P016 225 aa6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa6.94□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 MFSD2BA6NFX1 497 aa6.93□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
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SMAD3-211ENST00000559460 HTN3P15516 51 aa6.93□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
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SMAD3-211ENST00000559460 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.93□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 OR8J1Q8NGP2 316 aa6.93□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 PTX4Q96A99 478 aa6.93□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF503Q96F45 646 aa6.93□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 Q96M66 194 aa6.93□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 OR2D2Q9H210 308 aa6.93□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 AASSQ9UDR5 926 aa6.93□□□□□ -1.3
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SMAD3-211ENST00000559460 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
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SMAD3-211ENST00000559460 DFFBO76075 338 aa6.92□□□□□ -1.3
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SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP10-2P60368 255 aa6.92□□□□□ -1.3
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SMAD3-211ENST00000559460 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 SYS1Q8N2H4 156 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.92□□□□□ -1.3
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SMAD3-211ENST00000559460 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.92□□□□□ -1.3
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SMAD3-211ENST00000559460 RNF2Q99496 336 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 GHRLQ9UBU3 117 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 TAGLN3Q9UI15 199 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 ETV7Q9Y603 341 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 X6R8D5 127 aa6.92□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 SNTNA6NMZ2 147 aa6.91□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 TEX22C9J3V5 150 aa6.91□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 K7EMT4 169 aa6.91□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 DCTN3O75935 186 aa6.91□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SMAD3-211ENST00000559460 SIGIRRQ6IA17 410 aa6.91□□□□□ -1.3
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