RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	UTS2B	Q765I0	119 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	GAPT	Q8N292	157 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	NEK7	Q8TDX7	302 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	ST8SIA2	Q92186	375 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	C7orf34	Q96L11	122 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	RAB40C	Q96S21	281 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617		K7EQG2	157 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	ATP5G1	P05496	136 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	CDKN1B	P46527	198 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	ATP5G3	P48201	142 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	GLMP	Q8WWB7	406 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	FGGY	Q96C11	551 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	SPIN2A	Q99865	258 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	RABAC1	Q9UI14	185 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC2A5	P22732	501 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	RASSF2	P50749	326 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	PAFAH1B2	P68402	229 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	CMTM3	Q96MX0	182 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	EBF4	Q9BQW3	602 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	PAXX	Q9BUH6	204 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	IFNG	P01579	166 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	ATP6AP1	Q15904	470 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	EPGN	Q6UW88	154 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	CADM3	Q8N126	398 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A1W2PP11	408 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617		H3BMM0	161 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	SOCS1	O15524	211 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	HBE1	P02100	147 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	ISG15	P05161	165 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	DEFB1	P60022	68 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	KISS1	Q15726	138 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	SVOP	Q8N4V2	548 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	CXorf58	Q96LI9	332 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	GABRP	O00591	440 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	CCNK	O75909	580 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	GADD45G	O95257	159 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	NAPSA	O96009	420 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	APOA2	P02652	100 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	MT-ND2	P03891	347 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	UBE2K	P61086	200 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	SSX6	Q7RTT6	188 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	OR2T33	Q8NG76	320 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	C5orf30	Q96GV9	206 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617		V9GYQ6	96 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A096LPF7	62 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	CCDC182	A6NF36	153 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	CGB1	A6NKQ9	187 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	ANGPT2	O15123	496 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	ST8SIA3	O43173	380 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	CDRT1	O95170	752 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	OR5I1	Q13606	314 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	CGB2	Q6NT52	195 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF709	Q8N972	641 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	PXT1	Q8NFP0	134 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	OR2T12	Q8NG77	320 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	DCANP1	Q8TF63	244 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	OR10C1	Q96KK4	312 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	VSIR	Q9H7M9	311 aa		7.27	□□□□□ -1.25

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