RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 PVRIGQ6DKI7 326 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.23□□□□□ -1.25
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PTPRB-208ENST00000550358 FAM131CQ96AQ9 280 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 AMELYQ99218 206 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
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PTPRB-208ENST00000550358 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
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PTPRB-208ENST00000550358 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.23□□□□□ -1.25
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PTPRB-208ENST00000550358 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.22□□□□□ -1.25
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PTPRB-208ENST00000550358 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
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PTPRB-208ENST00000550358 SLC25A17O43808 307 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 GHRHP01286 108 aa7.22□□□□□ -1.25
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PTPRB-208ENST00000550358 CLDND2Q8NHS1 167 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 C5orf66Q9H5L9 145 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 FUT9Q9Y231 359 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
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PTPRB-208ENST00000550358 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa7.21□□□□□ -1.25
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PTPRB-208ENST00000550358 PGPA6NDG6 321 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV1-2P23083 117 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF506Q5JVG8 444 aa7.21□□□□□ -1.25
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PTPRB-208ENST00000550358 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
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PTPRB-208ENST00000550358 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.21□□□□□ -1.26
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PTPRB-208ENST00000550358 IGHV3-7P01780 117 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 UQCRFS1P47985 274 aa7.21□□□□□ -1.26
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PTPRB-208ENST00000550358 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 PPP1R27Q86WC6 154 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 ARPC1AQ92747 370 aa7.21□□□□□ -1.26
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PTPRB-208ENST00000550358 FAM219BQ5XKK7 198 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF826PQ6ZT77 177 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 C19orf67A6NJJ6 358 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 TAS2R60P59551 318 aa7.2□□□□□ -1.26
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PTPRB-208ENST00000550358 NABP2Q9BQ15 211 aa7.2□□□□□ -1.26
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PTPRB-208ENST00000550358 IFITM10A6NMD0 228 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 SCO1O75880 301 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 GLIPR1P48060 266 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 BSPH1Q075Z2 132 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 LINC01559Q495D7 138 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF383Q8NA42 475 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 PRSS22Q9GZN4 317 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF205O95201 554 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 MINOS1Q5TGZ0 78 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 LEMD1Q68G75 181 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 OR52E5Q8NH55 327 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 ABHD17AQ96GS6 310 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa7.2□□□□□ -1.26
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