RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541869.5

POLR1B-217, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR1B, Length 5,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-217ENST00000541869 FAM78BQ5VT40 261 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 BAGE3Q86Y29 109 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 BAGE2Q86Y30 109 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 LRRC75AQ8NAA5 344 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 ANK1P16157 1881 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 KBTBD11O94819 623 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 PJVKQ0ZLH3 352 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 HAGHQ16775 308 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 DTX2Q86UW9 622 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 DRAM1Q8N682 238 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 H7BYZ3 331 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 NPBWR2P48146 333 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 SPCS3P61009 180 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 IGSF11Q5DX21 431 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 TOR2AQ5JU69 321 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 C11orf87Q6NUJ2 197 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 Q96M66 194 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 PLXNA3P51805 1871 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 KLF4O43474 513 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 SLC6A1P30531 599 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 CLEC18BQ6UXF7 455 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 TNFRSF14Q92956 283 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 MARC2Q969Z3 335 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 RTN4RQ9BZR6 473 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM262E9PQX1 116 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 RND2P52198 227 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 CRYBA2P53672 197 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 NR2C2APQ86WQ0 139 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 OR10S1Q8NGN2 331 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 A0A1W2PP11 408 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 DPRXA6NFQ7 191 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 GPX1P07203 203 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 AMTP48728 403 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 RAB32Q13637 225 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 VMO1Q7Z5L0 202 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 H0YL77 283 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 CD37P11049 281 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 C2orf68Q2NKX9 166 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 C3orf36Q3SXR2 165 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 M0R1W7 72 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 H0Y8G0 127 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 C1QBP02746 253 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 EFNB2P52799 333 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 RXFP4Q8TDU9 374 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 MMP24Q9Y5R2 645 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 CD5P06127 495 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 CCL3L1P16619 93 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 VAX1Q5SQQ9 334 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 LINC01587Q99440 93 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 VGLL1Q99990 258 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 AKIP1Q9NQ31 210 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 SMLR1H3BR10 107 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 ADAM10O14672 748 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 KLK2P20151 261 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 GPR183P32249 361 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 GATA4P43694 442 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 P2RY1P47900 373 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 SMIM7Q9BQ49 75 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 SSTR5P35346 364 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 ERVFC1-1P60608 527 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 B2MP61769 119 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 PLAC9Q5JTB6 97 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 PRSS54Q6PEW0 395 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 DEDDO75618 318 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM50BP56557 158 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 CD69Q07108 199 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 CLEC19AQ6UXS0 136 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 GBGT1Q8N5D6 347 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1B-217ENST00000541869 DUX3Q96PT4 197 aa8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms