RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533232.5

SOX9-AS1-212, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SOX9-AS1, Length 1,739 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-212ENST00000533232 FOXF2Q12947 444 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 TIMM23BQ5SRD1 257 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 Q6ZR03 302 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 PIP4P1Q86T03 277 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 ZADH2Q8N4Q0 377 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 GCSAMQ8N6F7 178 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 OR2Z1Q8NG97 314 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 OR4S2Q8NH73 311 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 ACY3Q96HD9 319 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 IMMP2LQ96T52 175 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 PARLQ9H300 379 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 MSL2Q9HCI7 577 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 R4GN57 208 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 MED12LQ86YW9 2145 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 LINC00473A8K010 186 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 C15orf62A8K5M9 175 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 C11orf94C9JXX5 98 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 FNDC10F2Z333 226 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 NKX2-8O15522 239 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 WISP2O76076 250 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 HRASP01112 189 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 IGKV1D-33P01593 117 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 IGKV1-33P01594 117 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 IGHV2-70P01814 119 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 CD55P08174 381 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 GLRXP35754 106 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 THBS3P49746 956 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 LCN2P80188 198 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 TNP2Q05952 138 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 EDDM3AQ14507 147 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 HNF4GQ14541 408 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 CD177Q8N6Q3 437 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 RFESDQ8TAC1 157 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 FRZBQ92765 325 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 STARD4Q96DR4 205 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 C5orf30Q96GV9 206 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 ENY2Q9NPA8 101 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 SLC25A15Q9Y619 301 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 M0R1X1 148 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 TMPRSS2O15393 492 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 PAGE4O60829 102 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 CXorf1O96002 111 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 CGAP01215 116 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 IGHV3-43DP0DP04 118 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 CD33P20138 364 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 TNFSF4P23510 183 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 TFF3Q07654 80 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 DUSP13Q9UII6 198 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 MED13Q9UHV7 2174 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 LINC00587B1AMM8 73 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 TM4SF5O14894 197 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 CEACAM4O75871 244 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 TNFSF13O75888 250 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 GYPAP02724 150 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 TYMSP04818 313 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 OR9G9P0C7N8 305 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 SSX2Q16385 188 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 SFXN3Q9BWM7 321 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 FAM234AQ9H0X4 552 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 ASCL3Q9NQ33 180 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 CALYQ9NYX4 217 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 DVL1O14640 695 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 LHBP01229 141 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 CRYABP02511 175 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 EDDM3BP56851 147 aa6.47□□□□□ -1.37
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