RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 CIB4A0PJX0 185 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ISPDA4D126 451 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 C5orf49A4QMS7 147 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 SEC14L6B5MCN3 397 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ZG16O60844 167 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 LYZL6O75951 148 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 FCGR3AP08637 254 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 CSF3P09919 207 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 CD79AP11912 226 aa3.27□□□□□ -1.89
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PTPRC-214ENST00000530727 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
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PTPRC-214ENST00000530727 Q8N402 240 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF491Q8N8L2 437 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 SYNPRQ8TBG9 265 aa3.26□□□□□ -1.89
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