RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516298.1

RNA5SP220-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 220, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP220, Length 104 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP220-201ENST00000516298 DYDC1Q8WWB3 177 aa0.31□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 HIST1H2ACQ93077 130 aa0.31□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 SLC35C1Q96A29 364 aa0.31□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 PGLYRP4Q96LB8 373 aa0.31□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 NMNAT3Q96T66 252 aa0.31□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 STACQ99469 402 aa0.31□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 GPR22Q99680 433 aa0.31□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 RNF5Q99942 180 aa0.31□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 GINS3Q9BRX5 216 aa0.31□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 SPRR2GQ9BYE4 73 aa0.31□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 GFRA4Q9GZZ7 299 aa0.31□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 SCPEP1Q9HB40 452 aa0.31□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 FAM118AQ9NWS6 357 aa0.31□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 NMRK1Q9NWW6 199 aa0.31□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 THYN1Q9P016 225 aa0.31□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa0.31□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 KIF25Q9UIL4 384 aa0.31□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 RIMS3Q9UJD0 308 aa0.31□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 FUT9Q9Y231 359 aa0.31□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 A0A0G2JRQ6 117 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 SULT1C2O00338 296 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 FAAHO00519 579 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 CYB5BO43169 146 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 LANCL1O43813 399 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 SNNO75324 88 aaPredicted RBP0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 ZNF737O75373 536 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 STK16O75716 305 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 OR5F1O95221 314 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 NAPSAO96009 420 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 HPRT1P00492 218 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 FGGP02679 453 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 SLPIP03973 132 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 HLA-DMAP28067 261 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 GABRB3P28472 473 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 YAP1P46937 504 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 MEOX2P50222 304 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 GZMMP51124 257 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 GNG3P63215 75 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 RPP30P78346 268 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 FGL1Q08830 312 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 GAGE2BQ13066 116 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 PRDX4Q13162 271 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 TMED1Q13445 227 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 AQP6Q13520 282 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 RIPK1Q13546 671 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 GAMTQ14353 236 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 GPR176Q14439 515 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 PSG5Q15238 335 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 HIST3H3Q16695 136 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 ANKDD1AQ495B1 522 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 IGSF11Q5DX21 431 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 C6orf136Q5SQH8 315 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 C10orf91Q5T1B1 145 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 C11orf63Q6NUN7 778 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 DHRS11Q6UWP2 260 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 Q6ZTI0 123 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 C16orf62Q7Z3J2 963 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 LINC00523Q86TU6 105 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 NIT1Q86X76 327 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 Q8N377 158 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 TCAIMQ8N3R3 496 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 LINC00311Q8N616 119 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 ZNF709Q8N972 641 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 NECAB1Q8N987 351 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 PXT1Q8NFP0 134 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 NEK11Q8NG66 645 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 OR9Q2Q8NGE9 314 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 OR10G4Q8NGN3 311 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 OR10D4PQ8NGN7 298 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 OR9I1Q8NGQ6 314 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 CNIH3Q8TBE1 160 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 STAG3L4Q8TBR4 150 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 LRRC8CQ8TDW0 803 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 AQP3Q92482 292 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 PEX13Q92968 403 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 C16orf92Q96LL3 132 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 DNAJC30Q96LL9 226 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 LINC00052Q96N35 136 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 MS4A4EQ96PG1 132 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 ODF3Q96PU9 254 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 TMEM237Q96Q45 408 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 SDF2Q99470 211 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 DERL2Q9GZP9 239 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 HDHD2Q9H0R4 259 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 GLIPR2Q9H4G4 154 aa0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
RNA5SP220-201ENST00000516298 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms