RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515564.5

GATB-212, Transcript of glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B, humanhuman

TSL 2

Gene GATB, Length 6,552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATB-212ENST00000515564 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa7.07□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 MARVELD3Q96A59 401 aa7.07□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 MARCH11A6NNE9 402 aa7.07□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 C10orf128Q5T292 105 aa7.07□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 VGLL1Q99990 258 aa7.07□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa7.07□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa7.07□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 PARP14Q460N5 1801 aa7.07□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 IGHMP01871 453 aa7.07□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 MIC13Q5XKP0 118 aa7.07□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 LRP11Q86VZ4 500 aa7.07□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 AQP3Q92482 292 aa7.07□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa7.07□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 NIT2Q9NQR4 276 aa7.07□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 SEMA5BQ9P283 1151 aa7.07□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.07□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 PITX3O75364 302 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 CKS2P33552 79 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 IER3P46695 156 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 NRIP2Q9BQI9 281 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 TRPM7Q96QT4 1865 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 KBTBD11O94819 623 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 GCGP01275 180 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 CD99P14209 185 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 EFNA4P52798 201 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 ZNF146Q15072 292 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 UQCC3Q6UW78 93 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 NPIPB3Q92617 1050 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 SMIM12Q96EX1 92 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 KCNE5Q9UJ90 142 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 H3BVH4 76 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 CD24P25063 80 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 PMS2P11Q13670 270 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 TEX261Q6UWH6 196 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 CTHRC1Q96CG8 243 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 TBX15Q96SF7 602 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 LRRC37AA6NMS7 1700 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 HKR1P10072 659 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 FSTP19883 344 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 SGK494Q96LW2 274 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 OR51M1Q9H341 326 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 KCNK7Q9Y2U2 307 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 KNTC1P50748 2209 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 KIF13BQ9NQT8 1826 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 MYOD1P15172 320 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 C2orf83Q53S99 150 aa7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 WNT2P09544 360 aa7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 RPL29P47914 159 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 LIMS1P48059 325 aa7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 PSG7Q13046 419 aa7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 UBE2V2Q15819 145 aa7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 ZNF880Q6PDB4 577 aa7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 OR51G1Q8NGK1 321 aa7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 GPR146Q96CH1 333 aa7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 PHOX2AO14813 284 aa7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 IFI6P09912 130 aa7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 MFAP2P55001 183 aa7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 AANATQ16613 207 aa7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 PINLYPA6NC86 204 aa7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 B4DSR2 109 aa7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 CCL3L1P16619 93 aa7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 Q0VFX4 171 aa7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 DMRTA2Q96SC8 542 aa7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 TMEM222Q9H0R3 208 aa7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 TCF19Q9Y242 345 aa7.05□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 A8MWL6 223 aa7.04□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 H7C2G1 150 aa7.04□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 ELOBQ15370 118 aa7.04□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 RAB37Q96AX2 223 aa7.04□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 DEPPQ9NTK1 212 aa7.04□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa7.04□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa7.04□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 KLF4O43474 513 aa7.04□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 FOXF2Q12947 444 aa7.04□□□□□ -1.28
GATB-212ENST00000515564 PCM1Q15154 2024 aa7.04□□□□□ -1.28
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