RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513398.1

ACTN3-203, Transcript of actinin alpha 3 (gene/pseudogene), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTN3, Length 2,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3-203ENST00000513398 NAGKQ9UJ70 344 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN3-203ENST00000513398 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN3-203ENST00000513398 LRBAP50851 2863 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTN3-203ENST00000513398 FAM90A26D6RGX4 464 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN3-203ENST00000513398 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ACTN3-203ENST00000513398 CELA3BP08861 270 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN3-203ENST00000513398 COX5AP20674 150 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN3-203ENST00000513398 TMPRSS3P57727 454 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN3-203ENST00000513398 TFF3Q07654 80 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN3-203ENST00000513398 SEM1Q6ZVN7 128 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN3-203ENST00000513398 TMEM256Q8N2U0 113 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN3-203ENST00000513398 CLN8Q9UBY8 286 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN3-203ENST00000513398 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ACTN3-203ENST00000513398 C11orf94C9JXX5 98 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN3-203ENST00000513398 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN3-203ENST00000513398 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ACTN3-203ENST00000513398 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ACTN3-203ENST00000513398 COX5BP10606 129 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN3-203ENST00000513398 EGR1P18146 543 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN3-203ENST00000513398 LCN2P80188 198 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN3-203ENST00000513398 DRAM1Q8N682 238 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN3-203ENST00000513398 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN3-203ENST00000513398 CFAP46Q8IYW2 2715 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTN3-203ENST00000513398 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa14.96□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 BMP5P22003 454 aa14.96□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 TDGF1P3P51864 188 aa14.96□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 ZNF709Q8N972 641 aa14.96□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 MS4A10Q96PG2 267 aa14.96□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 LILRA1O75019 489 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 NPPCP23582 126 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 ZNF573Q86YE8 665 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 KIR2DL5AQ8N109 375 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 OR5P3Q8WZ94 311 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 CLCF1Q9UBD9 225 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 ABCA4P78363 2273 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 A0A1B0GWJ7 208 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 SIRPB1O00241 398 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 CRYAAP02489 173 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 RPL29P47914 159 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 RPL15P61313 204 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 ATP6V1FQ16864 119 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 CST9LP1Q5W188 147 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 AQP7O14520 342 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 RHBDL1O75783 438 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 KRASP01116 189 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 FAM214BQ7L5A3 538 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 AKAP6Q13023 2319 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 OR10J1P30954 320 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 WNT5AP41221 380 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 GNG3P63215 75 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 MOB1BQ7L9L4 216 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 LINC01551Q86U37 167 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 OR10P1Q8NGE3 313 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 HSPB7Q9UBY9 170 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 TMEM210A6NLX4 147 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 RAB4AP20338 218 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 G6PCP35575 357 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 UBE2G2P60604 165 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 FBXW9Q5XUX1 488 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 FAM215AQ9Y5M1 114 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 DOCK11Q5JSL3 2073 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 PLCE1Q9P212 2302 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 RNF212BA8MTL3 300 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 NUPR1O60356 82 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 IGHV1-2P23083 117 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 GCH1P30793 250 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 MSMO1Q15800 293 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 NRN1LQ496H8 165 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 BTNL3Q6UXE8 466 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 GFRALQ6UXV0 394 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 TBX15Q96SF7 602 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 NPCDR1Q9BY65 106 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 IGSF10Q6WRI0 2623 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 MLNRO43193 412 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 OR5B21A6NL26 309 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 RAMP3O60896 148 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 Q6P435 159 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 LRP11Q86VZ4 500 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 SDSLQ96GA7 329 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 PXMP4Q9Y6I8 212 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 USP24Q9UPU5 2620 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 GNB1P62873 340 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 TMEM144Q7Z5S9 345 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 TMEM45BQ96B21 275 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 ESPL1Q14674 2120 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 ZG16O60844 167 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 ATP5G3P48201 142 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 MDP1Q86V88 176 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTN3-203ENST00000513398 OR1L1Q8NH94 360 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms