RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-223	ENST00000512131	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR4S2	Q8NH73	311 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZFP57	Q9NU63	452 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	TNC	P24821	2201 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131		M0QYG6	137 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGLV1-40	P01703	118 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	CD3D	P04234	171 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	PSMB8	P28062	276 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	KIR2DS2	P43631	304 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	UCP3	P55916	312 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	TAS2R19	P59542	299 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	TSPAN5	P62079	268 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR4F4	Q96R69	305 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	CLCC1	Q96S66	551 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	TENM3	Q9P273	2699 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	DPPA5	A6NC42	116 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	FABP12	A6NFH5	140 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	RAMP3	O60896	148 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	CATR1	Q13166	79 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	FXYD3	Q14802	87 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	MRAP	Q8TCY5	172 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	ARPC1A	Q92747	370 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131		V9GYH0	126 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	GPR31	O00270	319 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	SOX15	O60248	233 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF735	P0CB33	412 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRSS8	Q16651	343 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	CCDC190	Q86UF4	302 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	R3HDM4	Q96D70	268 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A1W2PRX2	142 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	RAB3D	O95716	219 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	IFNA6	P05013	189 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC6A1	P30531	599 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	POU2AF1	Q16633	256 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	RHOV	Q96L33	236 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	HPRT1	P00492	218 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	HRAS	P01112	189 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	RLN1	P04808	185 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	F2R	P25116	425 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	S100A5	P33763	92 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	ETV6	P41212	452 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	ECSCR	Q19T08	205 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	LFNG	Q8NES3	379 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR51H1	Q8NH63	302 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	TERB2	Q8NHR7	220 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	KLK15	Q9H2R5	256 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR2A4	O95047	310 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	CNIH1	O95406	144 aa		13.46	□□□□□ -0.25

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