RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495188.2

RNF146-208, Transcript of ring finger protein 146, human

TSL 2

Gene RNF146, Length 593 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF146-208	ENST00000495188	OR10D3	Q8NH80	312 aa		1.25	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		1.25	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		1.25	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188		Q8WTZ3	238 aa		1.25	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	ASB13	Q8WXK3	278 aa		1.25	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	ARL5B	Q96KC2	179 aa		1.25	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188		A0A1W2PP64	1363 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	C5orf49	A4QMS7	147 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188		F8W036	122 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188		M0QZ92	97 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	SLC16A4	O15374	487 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	TYMS	P04818	313 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	IL6	P05231	212 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	ATP5G1	P05496	136 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	CXCL2	P19875	107 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	CXCL3	P19876	107 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	BTN3A2	P78410	334 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	GNA13	Q14344	377 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	SLC36A2	Q495M3	483 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	CST9	Q5W186	159 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	SLC51B	Q86UW2	128 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	NAA40	Q86UY6	237 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	DERL2	Q9GZP9	239 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	WDR90	Q96KV7	1748 aa		1.23	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	LRRN3	E7EW58	273 aa		1.23	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188		H0Y980	276 aa		1.23	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	TXNDC9	O14530	226 aa		1.23	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	NIPSNAP2	O75323	286 aa		1.23	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF737	O75373	536 aa		1.23	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	1.23	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	NPY	P01303	97 aa		1.23	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	COX5B	P10606	129 aa		1.23	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	1.23	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	1.23	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	TMEM33	P57088	247 aa		1.23	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	FABP5	Q01469	135 aa		1.23	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	MGAT3	Q09327	533 aa		1.23	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	PPP1R1A	Q13522	171 aa		1.23	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		1.23	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	BAP18	Q8IXM2	172 aa		1.23	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	DAND5	Q8N907	189 aa		1.23	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	PIGX	Q8TBF5	258 aa		1.23	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		1.23	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188		Q96M85	177 aa		1.23	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		1.23	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	PARVG	Q9HBI0	331 aa		1.23	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	HES4	Q9HCC6	221 aa		1.23	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	EMC3	Q9P0I2	261 aa		1.23	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		1.23	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		1.22	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	DDT	P30046	118 aa		1.22	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	1.22	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	MYL6	P60660	151 aa		1.22	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	SNAP25	P60880	206 aa		1.22	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	CXCR4	P61073	352 aa		1.22	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	HLA-DRB3	P79483	266 aa		1.22	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	1.22	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		1.22	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		1.22	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	COMMD7	Q86VX2	200 aa		1.22	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	TESC	Q96BS2	214 aa		1.22	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	1.22	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	1.22	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		1.22	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		1.22	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	1.22	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	VCX3B	Q9H321	246 aa		1.22	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		1.22	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		1.22	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	1.22	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	GRIN2B	Q13224	1484 aa		1.22	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	ABCC11	Q96J66	1382 aa		1.21	□□□□□ -2.21
RNF146-208	ENST00000495188	SMIM23	A6NLE4	172 aa		1.21	□□□□□ -2.22
RNF146-208	ENST00000495188		M0R381	172 aa		1.21	□□□□□ -2.22
RNF146-208	ENST00000495188	E2F6	O75461	281 aa		1.21	□□□□□ -2.22
RNF146-208	ENST00000495188	MT-CO2	P00403	227 aa		1.21	□□□□□ -2.22
RNF146-208	ENST00000495188	HLA-DQB2	P05538	268 aa		1.21	□□□□□ -2.22
RNF146-208	ENST00000495188	IL3	P08700	152 aa		1.21	□□□□□ -2.22
RNF146-208	ENST00000495188	C8orf88	P0DMB2	117 aa		1.21	□□□□□ -2.22
RNF146-208	ENST00000495188	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	1.21	□□□□□ -2.22
RNF146-208	ENST00000495188	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	1.21	□□□□□ -2.22
RNF146-208	ENST00000495188	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	1.21	□□□□□ -2.22
RNF146-208	ENST00000495188	NNAT	Q16517	81 aa		1.21	□□□□□ -2.22
RNF146-208	ENST00000495188	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	1.21	□□□□□ -2.22
RNF146-208	ENST00000495188	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		1.21	□□□□□ -2.22
RNF146-208	ENST00000495188	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		1.21	□□□□□ -2.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms