RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 FAAP24Q9BTP7 215 aa5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 ELOVL1Q9BW60 279 aa5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 IFT46Q9NQC8 304 aa5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 COPZ2Q9P299 210 aa5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 GLS2Q9UI32 602 aa5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 AK3Q9UIJ7 227 aa5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 HSF4Q9ULV5 492 aa5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 ST3GAL6Q9Y274 331 aa5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 C7orf66A4D0T2 115 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 IZUMO1RA6ND01 250 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 H0Y980 276 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 SIRPB1O00241 398 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 ATP6V0E1O15342 81 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 PDCD6O75340 191 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 CA11O75493 328 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 NDUFB6O95139 128 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 OR2H2O95918 312 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 DHFRP00374 187 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 MOSP00540 346 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 PMP2P02689 132 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 CSN2P05814 226 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 NAT1P18440 290 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 FAUP35544 74 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 REG1BP48304 166 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 AKAP14Q86UN6 197 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 GTSCR1Q86UQ5 136 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 HOGA1Q86XE5 327 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 FAM58AQ8N1B3 248 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 BEST4Q8NFU0 473 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 OR13C8Q8NGS7 320 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 OR4K15Q8NH41 348 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 DEDD2Q8WXF8 326 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 PPP1R14BQ96C90 147 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 GINS4Q9BRT9 223 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 RSRP1Q9BUV0 290 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 PLEKHA3Q9HB20 300 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 OR6C3Q9NZP0 311 aa5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 TRAV41A0A0B4J266 112 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 A0A1W2PPE3 182 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 UBE2QL1A1L167 161 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 DISC1C4P0D8 188 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 CCNKO75909 580 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 CNIH1O95406 144 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 TRAPPC2P0DI81 140 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 TRAPPC2BP0DI82 140 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 PRKACAP17612 351 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 HRH1P35367 487 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 CBX5P45973 191 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 GNG10P50151 68 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 MECP2P51608 486 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 CBX3Q13185 183 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 MEF2DQ14814 521 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 ARL6IP1Q15041 203 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 NHLRC3Q5JS37 347 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 KRBOX4Q5JUW0 171 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 SPIN3Q5JUX0 258 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 ATAD3CQ5T2N8 411 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 Q6P435 159 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 IDO2Q6ZQW0 420 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 Q8IYB0 196 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 OR13A1Q8NGR1 328 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 OR6F1Q8NGZ6 308 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 CASTOR1Q8WTX7 329 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 GIMAP1Q8WWP7 306 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 MRGPRFQ96AM1 343 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 ST6GAL2Q96JF0 529 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 RHOVQ96L33 236 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 SEC22CQ9BRL7 303 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 CALYQ9NYX4 217 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF221Q9UK13 617 aa5.44□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 TRAV24A0A0B4J272 114 aa5.43□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 A0A0J9YWU9 116 aa5.43□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 FAM90A7PA6NKC0 464 aa5.43□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa5.43□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 SH2D1BO14796 132 aa5.43□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 IGHV3-11P01762 117 aa5.43□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 RLN1P04808 185 aa5.43□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 FCGR3AP08637 254 aa5.43□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms