RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	APOA1	P02647	267 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	OR8U8	P0C7N1	319 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	RFX2	P48378	723 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	UBE2K	P61086	200 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	SSX9	Q7RTT3	188 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	MFSD4A	Q8N468	514 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	AP3S1	Q92572	193 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	MSGN1	A6NI15	193 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	SULT1C2	O00338	296 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	GABARAP	O95166	117 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	CRYGB	P07316	175 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	ELK1	P19419	428 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	HLA-DMA	P28067	261 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	TAS2R46	P59540	309 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	DEFA5	Q01523	94 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	CATR1	Q13166	79 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	PRSS8	Q16651	343 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	TEX45	Q8NA69	505 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	POC5	Q8NA72	575 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	OR51H1	Q8NH63	302 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880		I3L521	148 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	RGS5	O15539	181 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	IGLV2-14	P01704	120 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	KIR2DS2	P43631	304 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	SLURP1	P55000	103 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP10-11	P60412	298 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	TSPAN5	P62079	268 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	CTF1	Q16619	201 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	MMD2	Q8IY49	270 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	TNC	P24821	2201 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880		A0A087WW49	117 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	DPPA5	A6NC42	116 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	LINC01619	G3V211	115 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	HRAS	P01112	189 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	HRH1	P35367	487 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	OVOL1	O14753	267 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	RAMP3	O60896	148 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	OR2A4	O95047	310 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	LY86	O95711	162 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	RPA2	P15927	270 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	ECI1	P42126	302 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	DGCR2	P98153	550 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	DYRK1A	Q13627	763 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	DCUN1D4	Q92564	292 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	BORCS5	Q969J3	196 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	RHOV	Q96L33	236 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM68	Q96MH6	324 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	CMTM3	Q96MX0	182 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	OR2A7	Q96R45	310 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	SPIN2A	Q99865	258 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880		A0A0G2JLM5	398 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	SAP30	O75446	220 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	KBTBD11	O94819	623 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	RLN1	P04808	185 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	RCVRN	P35243	200 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	ALDH3B2	P48448	385 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	RUNX1	Q01196	453 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	FHL3	Q13643	280 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SSR4-208	ENST00000471880	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		11.46	□□□□□ -0.57

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