RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464495.4

SOGA3-204, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene SOGA3, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-204ENST00000464495 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.15□□□□□ -1.26
SOGA3-204ENST00000464495 MGAT4AQ9UM21 535 aa7.15□□□□□ -1.26
SOGA3-204ENST00000464495 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa7.15□□□□□ -1.26
SOGA3-204ENST00000464495 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.14□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 J3QRE1 110 aa7.14□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 IFNA10P01566 189 aa7.14□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 IGLV2-23P01705 113 aa7.14□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 CRYGBP07316 175 aa7.14□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 TMEM187Q14656 261 aa7.14□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 PRSS8Q16651 343 aa7.14□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 HSP90B2PQ58FF3 399 aa7.14□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 KDM4DQ6B0I6 523 aa7.14□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.14□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 LHFPL3Q86UP9 236 aa7.14□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.14□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 ZNF645Q8N7E2 425 aa7.14□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 MUL1Q969V5 352 aa7.14□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.14□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.13□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.13□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 DEFB4AO15263 64 aa7.13□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 C8orf88P0DMB2 117 aa7.13□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 UBE2KP61086 200 aa7.13□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 FLOT2Q14254 428 aa7.13□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.13□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 CCDC58Q4VC31 144 aa7.13□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 C5orf24Q7Z6I8 188 aa7.13□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 CDH26Q8IXH8 852 aa7.13□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 PTX4Q96A99 478 aa7.13□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 GHRLQ9UBU3 117 aa7.13□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.13□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 CA1P00915 261 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 IGHV3-23P01764 117 aa7.12□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 AMBPP02760 352 aa7.12□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 HLA-DMBP28068 263 aa7.12□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 PSMB6P28072 239 aa7.12□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.12□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 MMD2Q8IY49 270 aa7.12□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 CXorf58Q96LI9 332 aa7.12□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 CIB1Q99828 191 aa7.12□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa7.12□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 DNAH2Q9P225 4427 aa7.12□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 PKD1P98161 4303 aa7.11□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 E9PI62 339 aa7.11□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 DEFA4P12838 97 aa7.11□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 CALB2P22676 271 aa7.11□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 LIPKQ5VXJ0 399 aa7.11□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 SIGIRRQ6IA17 410 aa7.11□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.11□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 LGALS12Q96DT0 336 aa7.11□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 CCDC140Q96MF4 163 aa7.11□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 FAAP24Q9BTP7 215 aa7.11□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 GABARAPL3Q9BY60 117 aa7.11□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa7.11□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 ERVK13-1Q9NX77 482 aa7.11□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 OR1A1Q9P1Q5 309 aa7.11□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 HERC1Q15751 4861 aa7.1□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.1□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 NPIPB5A8MRT5 1133 aa7.1□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 NOTOA8MTQ0 251 aa7.1□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 PROP1O75360 226 aa7.1□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 NAPSAO96009 420 aa7.1□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 CLEC3BP05452 202 aa7.1□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 UBBP0CG47 229 aa7.1□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 MIFP14174 115 aa7.1□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 SERPINB10P48595 397 aa7.1□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 LINC00205P59089 165 aa7.1□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 HLA-DRB3P79483 266 aa7.1□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 CDK10Q15131 360 aa7.1□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 PLET1Q6UQ28 207 aa7.1□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 IDO2Q6ZQW0 420 aa7.1□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 Q6ZTC4 211 aa7.1□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 ADTRPQ96IZ2 230 aa7.1□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.1□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.1□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 ORC6Q9Y5N6 252 aa7.1□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.1□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.09□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa7.09□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 CYB5BO43169 146 aa7.09□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 CRYZL1O95825 349 aa7.09□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 NPY1RP25929 384 aa7.09□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.09□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 Q499Y3 187 aa7.09□□□□□ -1.27
SOGA3-204ENST00000464495 TMEM41BQ5BJD5 291 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms