RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460912.6

SYNE1-215, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1, human

TSL 1 (best)

Gene SYNE1, Length 3,664 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SYNE1-215	ENST00000460912	ARG2	P78540	354 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	POU2AF1	Q16633	256 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	MORN2	Q502X0	79 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	TVP23C	Q96ET8	276 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	DYSF	O75923	2080 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	OR9G9	P0C7N8	305 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	TIMP3	P35625	211 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	COL10A1	Q03692	680 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	AES	Q08117	197 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912		A6NNC1	897 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	AHRR	A9YTQ3	701 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	OR2C1	O95371	312 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	SSTR5	P35346	364 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	ATP6V1F	Q16864	119 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	VAX2	Q9UIW0	290 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	RNF212B	A8MTL3	300 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912		H3BP45	60 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	AGFG2	O95081	481 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	G6PC	P35575	357 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	RELB	Q01201	579 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	GALM	Q96C23	342 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	MISP3	Q96FF7	219 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	OR2D2	Q9H210	308 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	OR5H1	A6NKK0	313 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	TMPRSS2	O15393	492 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	TYMS	P04818	313 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	SERPINE2	P07093	398 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	TFF3	Q07654	80 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	ERAS	Q7Z444	233 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	ZNF596	Q8TC21	504 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	CORO2A	Q92828	525 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	OR51B6	Q9H340	312 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	USF3	Q68DE3	2245 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	TMEM250	H0YL14	139 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	NXPH2	O95156	264 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	IAPP	P10997	89 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	GZMH	P20718	246 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	VAMP2	P63027	116 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	P2RY6	Q15077	328 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	JPT1	Q9UK76	154 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	ZG16	O60844	167 aa		7.21	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		7.21	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	STUM	Q69YW2	141 aa		7.21	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		7.21	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	SDSL	Q96GA7	329 aa		7.21	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		7.21	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		7.21	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		7.21	□□□□□ -1.25
SYNE1-215	ENST00000460912	WDR1	O75083	606 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SYNE1-215	ENST00000460912	PRH1	P02810	166 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SYNE1-215	ENST00000460912	ADH4	P08319	380 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SYNE1-215	ENST00000460912	FABP4	P15090	132 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SYNE1-215	ENST00000460912	CCKAR	P32238	428 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SYNE1-215	ENST00000460912	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SYNE1-215	ENST00000460912	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SYNE1-215	ENST00000460912	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SYNE1-215	ENST00000460912	OR51M1	Q9H341	326 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SYNE1-215	ENST00000460912	SLC31A2	O15432	143 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SYNE1-215	ENST00000460912	KBTBD11	O94819	623 aa		7.21	□□□□□ -1.26

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