RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453122.1

HJURP-208, Transcript of Holliday junction recognition protein, human

TSL 4

Gene HJURP, Length 634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HJURP-208	ENST00000453122		A0A087WXM4	84 aa		12.93	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	MSGN1	A6NI15	193 aa		12.93	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	OR9G9	P0C7N8	305 aa		12.93	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	CBX5	P45973	191 aa		12.93	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		12.93	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		12.93	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		12.93	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	SPIN2A	Q99865	258 aa		12.93	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		12.93	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		12.93	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		12.92	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	AIRE	O43918	545 aa		12.92	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	TNFAIP8	O95379	198 aa		12.92	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		12.92	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	KIR2DS2	P43631	304 aa		12.92	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	MSMO1	Q15800	293 aa		12.92	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		12.92	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		12.92	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	HOGA1	Q86XE5	327 aa		12.92	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		12.91	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	TATDN3	Q17R31	274 aa		12.91	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		12.91	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		12.91	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		12.91	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		12.91	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	FAM223B	A6NKX1	122 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	OR2A4	O95047	310 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	IGLV2-14	P01704	120 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	APELA	P0DMC3	54 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	GP9	P14770	177 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	SPN	P16150	400 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	FCGR2C	P31995	323 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	MFSD4A	Q8N468	514 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	OR2A7	Q96R45	310 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	IFT46	Q9NQC8	304 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		12.9	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
HJURP-208	ENST00000453122	XRCC3	O43542	346 aa		12.89	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	KBTBD11	O94819	623 aa		12.89	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	HRAS	P01112	189 aa		12.89	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	PPY	P01298	95 aa		12.89	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	MAS1L	P35410	378 aa		12.89	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	CATR1	Q13166	79 aa		12.89	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	FAM209B	Q5JX69	171 aa		12.89	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		12.89	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	BORCS5	Q969J3	196 aa		12.89	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122		U3KQK5	164 aa		12.89	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	COL7A1	Q02388	2944 aa		12.89	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	DYRK1A	Q13627	763 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	RPEL1	Q2QD12	228 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	SNAPC3	Q92966	411 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	YIPF6	Q96EC8	236 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		12.88	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	DPPA5	A6NC42	116 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	HERV-K104	P61576	105 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	RHOG	P84095	191 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	DEFA5	Q01523	94 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	ATP5G2	Q06055	141 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		12.87	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	SORL1	Q92673	2214 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	12.86	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	TNFSF12	O43508	249 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	IGLV1-51	P01701	117 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	SYNJ2BP	P57105	145 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	FXYD4	P59646	89 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	NECAP1	Q8NC96	275 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	OR4A5	Q8NH83	315 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		12.86	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
HJURP-208	ENST00000453122	ASCL2	Q99929	193 aa		12.86	□□□□□ -0.35

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