RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 NAA60Q9H7X0 242 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 HILPDAQ9Y5L2 63 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 A6NDX4 124 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 VGLL3A8MV65 326 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 OOSP1A8MZH6 123 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 TXNL1O43396 289 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 IL5P05113 134 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 VAMP1P23763 118 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 F2RP25116 425 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 REG1BP48304 166 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 THBS3P49746 956 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 TATDN3Q17R31 274 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 KCTD9Q7L273 389 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 SEC22CQ9BRL7 303 aa9.91□□□□□ -0.82
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PRAME-208ENST00000438888 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 C9orf170A2RU37 121 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 LINC00473A8K010 186 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 H0Y980 276 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 B3GALNT1O75752 331 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 SFT2D2O95562 160 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 OR5AC1P0C628 307 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 CT45A6P0DMU7 189 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 CT45A5P0DMU8 189 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 CT45A7P0DMV0 189 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 ANXA3P12429 323 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 RPL30P62888 115 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 BLCAPP62952 87 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 DHRS2Q13268 280 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 Q6ZNX1 250 aa9.9□□□□□ -0.82
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PRAME-208ENST00000438888 Q8N2B8 174 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 ZNF383Q8NA42 475 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 MALSU1Q96EH3 234 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 GALNT14Q96FL9 552 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 NABP2Q9BQ15 211 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 PITPNC1Q9UKF7 332 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-208ENST00000438888 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa9.9□□□□□ -0.82
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PRAME-208ENST00000438888 A0A0B4J293 547 aa9.89□□□□□ -0.83
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PRAME-208ENST00000438888 A0A1W2PPI3 338 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 C7orf66A4D0T2 115 aa9.89□□□□□ -0.83
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PRAME-208ENST00000438888 OR8H3Q8N146 312 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 OR52B4Q8NGK2 314 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 CASTOR1Q8WTX7 329 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 DDB2Q92466 427 aa9.89□□□□□ -0.83
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PRAME-208ENST00000438888 DNAH3Q8TD57 4116 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 SNRPGP15A8MWD9 76 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 H0YJW9 148 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 FCGR3BO75015 233 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 SERPINE2P07093 398 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 PF4V1P10720 104 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 CD24P25063 80 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 UCP1P25874 307 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 ARHGDIBP52566 201 aa9.88□□□□□ -0.83
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PRAME-208ENST00000438888 CBX3Q13185 183 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 RTL8BQ17RB0 113 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 SPAG16Q8N0X2 631 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 OR5AN1Q8NGI8 311 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 CD300LFQ8TDQ1 290 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 WNT10AQ9GZT5 417 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 TMEM222Q9H0R3 208 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 SLC35D1Q9NTN3 355 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 H7C2Y5 167 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 PF4P02776 101 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 RRASP10301 218 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-208ENST00000438888 MC5RP33032 325 aa9.87□□□□□ -0.83
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