RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438547.6

SEMA4D-211, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEMA4D, Length 4,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4D-211ENST00000438547 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 JPT1Q9UK76 154 aa9.53□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 AKAP6Q13023 2319 aa9.53□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 LNP1A1A4G5 178 aa9.53□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 SYNGR3O43761 229 aa9.53□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 SOD3P08294 240 aa9.53□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 HOXA5P20719 270 aa9.53□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 RND2P52198 227 aa9.53□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 CDCP2Q5VXM1 449 aa9.53□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 DPF1Q92782 380 aa9.53□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 PATJQ8NI35 1801 aa9.53□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 PRR33A8MZF0 331 aa9.53□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 AMY1AP04745 511 aa9.53□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 MYOZ3Q8TDC0 251 aa9.53□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 VWCEQ96DN2 955 aa9.53□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa9.53□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 TNFRSF19Q9NS68 423 aa9.53□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 A0A087WWC5 75 aa9.52□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF124Q15973 351 aa9.52□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa9.52□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 NABP2Q9BQ15 211 aa9.52□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 SFXN3Q9BWM7 321 aa9.52□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 DCAF16Q9NXF7 216 aa9.52□□□□□ -0.88
SEMA4D-211ENST00000438547 CBLN1P23435 193 aa9.52□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 GCHFRP30047 84 aa9.52□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 NMUP48645 174 aa9.52□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 C12orf54Q6X4T0 127 aa9.52□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 CLDN18P56856 261 aa9.52□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 LCN2P80188 198 aa9.52□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.52□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 LINC00470Q9BZP3 86 aa9.52□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 FREM3P0C091 2139 aa9.52□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 ABCA7Q8IZY2 2146 aa9.52□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa9.52□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 AHRRA9YTQ3 701 aa9.52□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 J3KRW8 73 aa9.52□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 NPIPB7O75200 414 aa9.52□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 RFPL3SP0C7P2 107 aa9.52□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 CLDND2Q8NHS1 167 aa9.52□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 LEAP2Q969E1 77 aa9.52□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 TMEM189A5PLL7 270 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 PROB1E7EW31 1015 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 CA2P00918 260 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 TCTAP57738 103 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 HERVK_113P61574 105 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 RTP5Q14D33 572 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 HSPB7Q9UBY9 170 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 DOCK4Q8N1I0 1966 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 MPZP25189 248 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 STPG3Q8N7X2 389 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 MED12Q93074 2177 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 F2RL2O00254 374 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 FOLR2P14207 255 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 MAS1LP35410 378 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 CRIPAKQ8N1N5 446 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 DIRC2Q96SL1 478 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 C19orf24Q9BVV8 132 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 SDF2L1Q9HCN8 221 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 PSMB2P49721 201 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 TMEM177Q53S58 311 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 RTN4RQ9BZR6 473 aa9.51□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 C5orf52A6NGY3 159 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 C12orf77C9JDV5 145 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 J3QW42 95 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC25A17O43808 307 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 KRTCAP3Q53RY4 240 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 OR51G1Q8NGK1 321 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 PSME4Q14997 1843 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 GAGE10A6NGK3 116 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 RRHO14718 337 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 CENPWQ5EE01 88 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 SPANXN1Q5VSR9 72 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC25A34Q6PIV7 304 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 MUC15Q8N387 334 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM89BQ8N5H3 189 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA4D-211ENST00000438547 GATAD1Q8WUU5 269 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms