RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MOB3AQ96BX8 217 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXD-AS2-201ENST00000426965 P2RX4Q99571 388 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SCOCQ9UIL1 159 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GNRHRP30968 328 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM65Q6PI78 240 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF491Q8N8L2 437 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GNB4Q9HAV0 340 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RGS5O15539 181 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RAMP3O60896 148 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CNIH1O95406 144 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IGLL1P15814 213 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RCVRNP35243 200 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYCNOSP40205 109 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HERV-K104P61576 105 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRSS8Q16651 343 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ACTBL2Q562R1 376 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR52I2Q8NH67 350 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR4S2Q8NH73 311 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C4orf3Q8WVX3 66 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UBE2E2Q96LR5 201 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FXYD6Q9H0Q3 95 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KLK11Q9UBX7 282 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCL24O00175 119 aa19.43■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TPPPO94811 219 aa19.43■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ASPHD1Q5U4P2 390 aa19.43■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WIPF1O43516 503 aa19.42■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR5M8Q8NGP6 311 aa19.42■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR6F1Q8NGZ6 308 aa19.42■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NOL3O60936 208 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPAG16Q8N0X2 631 aa19.41■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VSIG4Q9Y279 399 aa19.41■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 I3L521 148 aa19.4■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIR2DS2P43631 304 aa19.4■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR5T1Q8NG75 326 aa19.4■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MS4A10Q96PG2 267 aa19.4■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR5B12Q96R08 314 aa19.4■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MTFP1Q9UDX5 166 aa19.4■□□□□ 0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 M0QYG6 137 aa19.39■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP19.39■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TNXAQ16473 311 aa19.39■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VAX1Q5SQQ9 334 aa19.39■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR51H1Q8NH63 302 aa19.39■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MSGN1A6NI15 193 aa19.38■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 APELAP0DMC3 54 aa19.38■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TSPAN5P62079 268 aa19.38■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DGCR2P98153 550 aa19.38■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RUNX1Q01196 453 aa19.38■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CATR1Q13166 79 aa19.38■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FHL3Q13643 280 aa19.38■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C10orf55Q5SWW7 151 aa19.38■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AADACL3Q5VUY0 350 aa19.38■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PYHIN1Q6K0P9 492 aa19.38■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C15orf40Q8WUR7 153 aa19.38■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RHOVQ96L33 236 aa19.38■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TNCP24821 2201 aa19.37■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR2A4O95047 310 aa19.37■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CD3DP04234 171 aa19.37■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SSX9Q7RTT3 188 aa19.37■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR11H1Q8NG94 326 aa19.37■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa19.37■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FCAMRQ8WWV6 532 aa19.37■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BORCS5Q969J3 196 aa19.37■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR2A7Q96R45 310 aa19.37■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GABARAPH6UMI1 98 aa19.36■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KBTBD11O94819 623 aa19.36■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HRASP01112 189 aa19.36■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RLN1P04808 185 aa19.36■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MMD2Q8IY49 270 aa19.36■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POC5Q8NA72 575 aa19.36■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DIRAS2Q96HU8 199 aa19.36■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM68Q96MH6 324 aa19.36■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPR31O00270 319 aa19.35■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HPRT1P00492 218 aa19.35■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TPPP2P59282 170 aa19.35■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FOXB2Q5VYV0 432 aa19.35■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR4D10Q8NGI6 311 aa19.35■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VSTM2AQ8TAG5 236 aa19.35■□□□□ 0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RSRP1Q9BUV0 290 aa19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms