RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419253.1

TTC28-AS1-203, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 846 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TNXAQ16473 311 aa9.69□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DEFB136Q30KP8 78 aa9.69□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ETV3LQ6ZN32 361 aa9.69□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OVCH2Q7RTZ1 564 aa9.69□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MMD2Q8IY49 270 aa9.69□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR11H1Q8NG94 326 aa9.69□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR6F1Q8NGZ6 308 aa9.69□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RAB2BQ8WUD1 216 aa9.69□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C15orf40Q8WUR7 153 aa9.69□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MS4A10Q96PG2 267 aa9.69□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR5B12Q96R08 314 aa9.69□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 P2RX4Q99571 388 aa9.69□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLA2Q9H6Q3 261 aa9.69□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SULT1C2O00338 296 aa9.68□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IGLV2-14P01704 120 aa9.68□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRGV3P03979 118 aa9.68□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CRYGBP07316 175 aa9.68□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HLA-DMAP28067 261 aa9.68□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RCVRNP35243 200 aa9.68□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RPL5P46777 297 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RPL30P62888 115 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PJVKQ0ZLH3 352 aa9.68□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DYRK1AQ13627 763 aa9.68□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRSS8Q16651 343 aa9.68□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IDO2Q6ZQW0 420 aa9.68□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CMTM1Q8IZ96 169 aa9.68□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR5T1Q8NG75 326 aa9.68□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR1N2Q8NGR9 330 aa9.68□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GPX8Q8TED1 209 aa9.68□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BCL7BQ9BQE9 202 aa9.68□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EXTL2Q9UBQ6 330 aa9.68□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 A0A0G2JLM5 398 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MSGN1A6NI15 193 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 H3BUA1 57 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR2A4O95047 310 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IFNA6P05013 189 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR8U8P0C7N1 319 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NAT1P18440 290 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HRH1P35367 487 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMBIM6P55061 237 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF616Q08AN1 781 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AADACL3Q5VUY0 350 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FOXB2Q5VYV0 432 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LPCAT3Q6P1A2 487 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DHRS11Q6UWP2 260 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SPAG16Q8N0X2 631 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MYOZ3Q8TDC0 251 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CD300LFQ8TDQ1 290 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CASTOR1Q8WTX7 329 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR2A7Q96R45 310 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SPIN2AQ99865 258 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GNB4Q9HAV0 340 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 COA4Q9NYJ1 87 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SCOCQ9UIL1 159 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ANAPC10Q9UM13 185 aa9.67□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SOX15O60248 233 aa9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RUNX1Q01196 453 aa9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C19orf54Q5BKX5 351 aa9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR51H1Q8NH63 302 aa9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MOB3AQ96BX8 217 aa9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RHOVQ96L33 236 aa9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GPHA2Q96T91 129 aa9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DPPA5A6NC42 116 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCDC160A6NGH7 325 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 I3L521 148 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TPPPO94811 219 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KBTBD11O94819 623 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HPRT1P00492 218 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IGHV3-11P01762 117 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 APELAP0DMC3 54 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MAS1LP35410 378 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ERVK-16P61578 105 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SPCS2Q15005 226 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C9orf66Q5T8R8 295 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SSX9Q7RTT3 188 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC25A42Q86VD7 318 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LYSMD2Q8IV50 215 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MRAPQ8TCY5 172 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FCAMRQ8WWV6 532 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HRASLSQ9HDD0 168 aa9.65□□□□□ -0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TNCP24821 2201 aa9.64□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SEC14L6B5MCN3 397 aa9.64□□□□□ -0.87
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LINC01619G3V211 115 aa9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms