RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 GRAMD2BQ96HH9 432 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 DLL3Q9NYJ7 618 aa8.38□□□□□ -1.07
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HERC3-202ENST00000402738 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 CD33P20138 364 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 UBE2V1Q13404 147 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
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HERC3-202ENST00000402738 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.38□□□□□ -1.07
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HERC3-202ENST00000402738 FAM90A16PA6NEW6 464 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa8.38□□□□□ -1.07
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HERC3-202ENST00000402738 FAM90A7PA6NKC0 464 aa8.38□□□□□ -1.07
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HERC3-202ENST00000402738 FAM90A24PP0C7X0 464 aa8.38□□□□□ -1.07
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HERC3-202ENST00000402738 LOXL2Q9Y4K0 774 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 C17orf51A8MQB3 221 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 PRR32B1ATL7 298 aa8.37□□□□□ -1.07
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HERC3-202ENST00000402738 J3QRE1 110 aa8.37□□□□□ -1.07
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HERC3-202ENST00000402738 C3AR1Q16581 482 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa8.37□□□□□ -1.07
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HERC3-202ENST00000402738 GAB4Q2WGN9 574 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 DCAF10Q5QP82 559 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 RHBDD2Q6NTF9 364 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 DRAM1Q8N682 238 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 SPINT1O43278 529 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 PRSS2P07478 247 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 NPSP0C0P6 89 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 UCP1P25874 307 aa8.37□□□□□ -1.07
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HERC3-202ENST00000402738 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 TMEM242Q9NWH2 141 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 SIT1Q9Y3P8 196 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 MCM3APO60318 1980 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
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HERC3-202ENST00000402738 ATG2BQ96BY7 2078 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 DIRC2Q96SL1 478 aa8.37□□□□□ -1.07
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HERC3-202ENST00000402738 NAPSAO96009 420 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 C1orf185Q5T7R7 199 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 GUSBP11Q6P575 273 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 LOXL4Q96JB6 756 aa8.36□□□□□ -1.07
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HERC3-202ENST00000402738 OR11H12B2RN74 326 aa8.36□□□□□ -1.07
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HERC3-202ENST00000402738 SELENOTP62341 195 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 KLRB1Q12918 225 aa8.36□□□□□ -1.07
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HERC3-202ENST00000402738 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 OR11H1Q8NG94 326 aa8.36□□□□□ -1.07
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HERC3-202ENST00000402738 ASXL3Q9C0F0 2248 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 A0A0J9YW62 118 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 VEGFBP49765 207 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 C18orf12Q96KH6 178 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 PSG1P11464 419 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 AREGP15514 252 aa8.35□□□□□ -1.07
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