RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384525.1

RNU6-1117P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1117, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1117P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1117P-201ENST00000384525 LY6G6CO95867 125 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 MSNP26038 577 aaKnown RBP-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 FXYD2P54710 66 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RPL31P62899 125 aaKnown RBP-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 OR8G5Q8NG78 346 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 OR51A7Q8NH64 312 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 DTD1Q8TEA8 209 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 UNC13CQ8NB66 2214 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ITPR3Q14573 2671 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CDK14O94921 469 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CPN2P22792 545 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TTPAP49638 278 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 STX5Q13190 355 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CDKL4Q5MAI5 379 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 FAM162BQ5T6X4 162 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 OPALINQ96PE5 141 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 MED28Q9H204 178 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 BLZF1Q9H2G9 400 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 OR51B6Q9H340 312 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ODF2LQ9ULJ1 636 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PKDREJQ9NTG1 2253 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 MYO7AQ13402 2215 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ODAMA1E959 279 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 OR6C6A6NF89 314 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RNF13O43567 381 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 GPM6BQ13491 265 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CCDC184Q52MB2 194 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ATPAF2Q8N5M1 289 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 MAT2BQ9NZL9 334 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 NUP160Q12769 1436 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 LIPCP11150 499 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 C1QTNF8P60827 252 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 LINC01554Q52M75 96 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TRAM1L1Q8N609 369 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 OR13C2Q8NGS9 318 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 OR13C9Q8NGT0 318 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SFT2D1Q8WV19 159 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ISOC2Q96AB3 205 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TPD52L3Q96J77 140 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ARMC7Q9H6L4 198 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TIMM22Q9Y584 194 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CFDP00746 253 aaPredicted RBP-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 KLK1P06870 262 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TSPAN5P62079 268 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 BAXQ07812 192 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 AAED1Q7RTV5 226 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CADP27708 2225 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1117P-201ENST00000384525 GPRASP1Q5JY77 1395 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 OR2AG2A6NM03 316 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 H0YCG3 227 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 NUPR1O60356 82 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ERLIN1O75477 346 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 MIPP30301 263 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SSR2P43308 183 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 MAGEA2P43356 314 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 DNASE1L1P49184 302 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SULT1A2P50226 295 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SLC35B1P78383 322 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RHOGP84095 191 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 DNAJC3Q13217 504 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RCN1Q15293 331 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 C4orf26Q17RF5 130 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CLEC12BQ2HXU8 276 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 FAM74A1Q5RGS3 127 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PQLC3Q8N755 202 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 OR4C5Q8NGB2 326 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TMEM239Q8WW34 195 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 NUP58Q9BVL2 599 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RYR2Q92736 4967 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SIP14410 1827 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 MGAMO43451 1857 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TEX46H3BTG2 121 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CCL16O15467 120 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 LYZL6O75951 148 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 GIMD1P0DJR0 217 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 MIFP14174 115 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SRMP19623 302 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 GADD45AP24522 165 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CDK9P50750 372 aaKnown RBP-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TBPL1P62380 186 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PLCXD3Q63HM9 321 aa-3.24□□□□□ -2.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms