RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 EVI2AP22794 236 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 SBSNQ6UWP8 590 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 STAG3L4Q8TBR4 150 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM54Q969K7 222 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB37Q96AX2 223 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 AP1S3Q96PC3 154 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 PYGO2Q9BRQ0 406 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC17A9Q9BYT1 436 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 H3BS24 57 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 TAPBPO15533 448 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 CD1AP06126 327 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM50BP56557 158 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 DMRTC1Q5HYR2 192 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF126Q9BV68 326 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 ST20Q9HBF5 79 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 PRDM6Q9NQX0 595 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 GABRG2P18507 467 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 PPIBP23284 216 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 S100A3P33764 101 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 PPICP45877 212 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 LIM2P55344 173 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 DLX6P56179 175 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR5P61964 334 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 VSTM2AQ8TAG5 236 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 C15orf40Q8WUR7 153 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 VN1R3Q9BXE9 311 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A0B4J2E0 115 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1B0GX12 115 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 NEURL1O76050 574 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 SRP19P09132 144 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 HLA-DRB3P79483 266 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 RPTNQ6XPR3 784 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 OR10A2Q9H208 303 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 ATRXP46100 2492 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 TET1Q8NFU7 2136 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 EML5Q05BV3 1969 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 CELA2AP08217 269 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF43P17038 809 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 G6PCP35575 357 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 HMGA2P52926 109 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 KLRD1Q13241 179 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 DHRS13Q6UX07 377 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 DOK3Q7L591 496 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 DEFB106AQ8N104 65 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 C21orf62Q9NYP8 219 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 C1orf226A1L170 272 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 DPRXA6NFQ7 191 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM24AA6NFZ4 105 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 PRSS46E5RG02 174 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 LMO7DNF2Z398 122 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 NUDT14O95848 222 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 CRYAAP02489 173 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00482Q8N8I6 264 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 OR10P1Q8NGE3 313 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 DEPPQ9NTK1 212 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 hADV38S2A0JD32 116 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 H3BMH7 237 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 RER1O15258 196 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 MYOD1P15172 320 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 CD34P28906 385 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 CA7P43166 264 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 LGALS4P56470 323 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 EDDM3AQ14507 147 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 NR0B2Q15466 257 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 PMS2CLQ68D20 193 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 CXCL17Q6UXB2 119 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 HOGA1Q86XE5 327 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 OR51E1Q8TCB6 317 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 SAMD10Q9BYL1 202 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 CST11Q9H112 138 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 JPT2Q9H910 190 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1W2PPM0 123 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 CXorf1O96002 111 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 SRD5A1P18405 259 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 RND3P61587 244 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 MSMO1Q15800 293 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP1R27Q86WC6 154 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A33Q9BSK2 321 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 FANCMQ8IYD8 2048 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A087WV48 116 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 PIRTP0C851 137 aa5.68□□□□□ -1.5
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