RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 HBZP02008 142 aa11.03□□□□□ -0.64
TMOD1-202ENST00000375175 HOXC12P31275 282 aa11.03□□□□□ -0.64
TMOD1-202ENST00000375175 SOX8P57073 446 aa11.03□□□□□ -0.64
TMOD1-202ENST00000375175 RPL15P61313 204 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
TMOD1-202ENST00000375175 RPS16P62249 146 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
TMOD1-202ENST00000375175 FAM78BQ5VT40 261 aa11.03□□□□□ -0.64
TMOD1-202ENST00000375175 C11orf42Q8N5U0 333 aa11.03□□□□□ -0.64
TMOD1-202ENST00000375175 MRGPRDQ8TDS7 321 aa11.03□□□□□ -0.64
TMOD1-202ENST00000375175 FZR1Q9UM11 496 aa11.03□□□□□ -0.64
TMOD1-202ENST00000375175 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa11.03□□□□□ -0.64
TMOD1-202ENST00000375175 OOEPA6NGQ2 149 aa11.02□□□□□ -0.64
TMOD1-202ENST00000375175 FAM90A26D6RGX4 464 aa11.02□□□□□ -0.64
TMOD1-202ENST00000375175 YPEL1O60688 119 aa11.02□□□□□ -0.64
TMOD1-202ENST00000375175 IGKV1D-33P01593 117 aa11.02□□□□□ -0.64
TMOD1-202ENST00000375175 IGKV1-33P01594 117 aa11.02□□□□□ -0.64
TMOD1-202ENST00000375175 SRP14P37108 136 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
TMOD1-202ENST00000375175 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.64
TMOD1-202ENST00000375175 Q6ZWC4 215 aa11.02□□□□□ -0.64
TMOD1-202ENST00000375175 OR4F5Q8NH21 305 aa11.02□□□□□ -0.64
TMOD1-202ENST00000375175 ANAPC16Q96DE5 110 aa11.02□□□□□ -0.64
TMOD1-202ENST00000375175 YPEL2Q96QA6 119 aa11.02□□□□□ -0.64
TMOD1-202ENST00000375175 OR4F4Q96R69 305 aa11.02□□□□□ -0.64
TMOD1-202ENST00000375175 MANBALQ9NQG1 85 aa11.02□□□□□ -0.64
TMOD1-202ENST00000375175 GRIFINA4D1Z8 144 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 MLNRO43193 412 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 S1PR2O95136 353 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 CDKN1AP38936 164 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 RPP30P78346 268 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 CATR1Q13166 79 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 PLA2G2CQ5R387 149 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 TEX43Q6ZNM6 134 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 FAM214BQ7L5A3 538 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 TPRX1Q8N7U7 411 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 ZBTB34Q8NCN2 500 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM106BQ9NUM4 274 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 PPIAL4AQ9Y536 164 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 ODAMA1E959 279 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 C17orf98A8MV24 154 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 IGHV3-43DP0DP04 118 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 RAB7AP51149 207 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 FABP6P51161 128 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 CCL11P51671 97 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 SLC35E4Q6ICL7 350 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 RFESDQ8TAC1 157 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 C5orf30Q96GV9 206 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 SLC25A22Q9H936 323 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 HSPB7Q9UBY9 170 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 A0A0U1RQK1 487 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF320A2RRD8 509 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 LRRC30A6NM36 301 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 M0R296 226 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 PSMB3P49720 205 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 KCNIP4Q6PIL6 250 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 Q6ZT83 130 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 TCF23Q7RTU1 214 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 C11orf53Q8IXP5 236 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 CMTM2Q8TAZ6 248 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 CXXC4Q9H2H0 198 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 HES4Q9HCC6 221 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 ZFP30Q9Y2G7 519 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 DEFB108AA8MXU0 73 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM250H0YL14 139 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 WISP2O76076 250 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 CHRNB4P30926 498 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 COTL1Q14019 142 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 SPINK9Q5DT21 86 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 ACP7Q6ZNF0 438 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 MSL2Q9HCI7 577 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 CLCF1Q9UBD9 225 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 PXMP4Q9Y6I8 212 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 ZG16O60844 167 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 RBX1P62877 108 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 LTC4SQ16873 150 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM183BQ1AE95 376 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 Q6ZR03 302 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 OR10P1Q8NGE3 313 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 VN1R17PQ8TDU5 208 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 ZDHHC16Q969W1 377 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 COQ2Q96H96 371 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 LOXL4Q96JB6 756 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 VAMP8Q9BV40 100 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 METRNQ9UJH8 293 aa11□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 ADMP35318 185 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 LINC00205P59089 165 aa10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
TMOD1-202ENST00000375175 ACSM6Q6P461 480 aa10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125.9 ms