RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354662.5

LMO3-204, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 3,574 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-204ENST00000354662 SRIP30626 198 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 SPINT3P49223 89 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 TMPRSS3P57727 454 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 ATP5G2Q06055 141 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 ARFRP1Q13795 201 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 ALKBH6Q3KRA9 238 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 ZADH2Q8N4Q0 377 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 GTSF1Q8WW33 167 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 TMEM126AQ9H061 195 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 PRO0461Q9UI25 63 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 NCKAP5O14513 1909 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 C9JCJ5 164 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 C15orf65H3BRN8 121 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 TNFSF12O43508 249 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 AMY1AP04745 511 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 POU2AF1Q16633 256 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 ABCA11PQ4W5N1 156 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 TMEM215Q68D42 235 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 RAB40CQ96S21 281 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 OR10A2Q9H208 303 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 V9GYV3 84 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-204ENST00000354662 A0A1W2PRD5 423 aa6.9□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 A0A1W2PRF3 423 aa6.9□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 A0A1W2PRM7 423 aa6.9□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 M0R2Z0 102 aa6.9□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 CHST1O43916 411 aa6.9□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 MT-ATP8P03928 68 aa6.9□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 CISD3P0C7P0 127 aa6.9□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 ZNF20P17024 532 aa6.9□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 RPS24P62847 133 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 NTHL1P78549 312 aa6.9□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 PSG7Q13046 419 aa6.9□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 ZNF645Q8N7E2 425 aa6.9□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 LRP4O75096 1905 aa6.9□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 hDV102S1A0JD36 115 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 GLOD5A6NK44 160 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 LMX1BO60663 402 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 OR1D4P47884 311 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 ZIC1Q15915 447 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 MMD2Q8IY49 270 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 E9PLN8 166 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 F8WDY8 70 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 RENP00797 406 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 IGHV3-7P01780 117 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 FASLGP48023 281 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 LY6DQ14210 128 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 TESK1Q15569 626 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 OR52N5Q8NH56 324 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 WFDC5Q8TCV5 224 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 BADQ92934 168 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 PAGE4O60829 102 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 TBL1XO60907 577 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 PVRP15151 417 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 NTF4P34130 210 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 TIGITQ495A1 244 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 FHL5Q5TD97 284 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 OR2J3O76001 311 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 MPIG6BO95866 241 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 XGP55808 180 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 PLP2Q04941 152 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 ZNF878C9JN71 531 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 APCSP02743 223 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 OR3A4PP47883 348 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-204ENST00000354662 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms