RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639895.1

SPIN3-231, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 4,234 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-231	ENST00000639895	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	SARM1	Q6SZW1	724 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	CLTCL1	P53675	1640 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	TUBB2A	Q13885	445 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	TEX11	Q8IYF3	940 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	NPAT	Q14207	1427 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	CLTA	P09496	248 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	PSMD2	Q13200	908 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	EVI5L	Q96CN4	794 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	TET3	O43151	1660 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895		A6NNZ2	444 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	PSME1	Q06323	249 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	NLRP12	P59046	1061 aa		12.83	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		12.83	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		12.83	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		12.83	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		12.83	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	SH3GL3	Q99963	347 aa		12.83	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		12.83	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		12.83	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		12.83	□□□□□ -0.35
SPIN3-231	ENST00000639895	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895		H3BQF6	201 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	USP28	Q96RU2	1077 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	MSH6	P52701	1360 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF202	O95125	648 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	ATP8B2	P98198	1209 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	FLII	Q13045	1269 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	FANCL	Q9NW38	375 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895		E9PCH4	1651 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	ZFYVE9	O95405	1425 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	SMIM24	O75264	130 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	FUT8	Q9BYC5	575 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	CD248	Q9HCU0	757 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	ATP1A3	P13637	1013 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	TAF4B	Q92750	862 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	WDR24	Q96S15	920 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	SASH3	O75995	380 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	SCRN1	Q12765	414 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	PDCL	Q13371	301 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC35F6	Q8N357	371 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	NLRP6	P59044	892 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	CCDC96	Q2M329	555 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	LRRC31	Q6UY01	552 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	TCP11	Q8WWU5	503 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	GOPC	Q9HD26	462 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	MYO1F	O00160	1098 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	KRT86	O43790	486 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	PAX7	P23759	505 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	PSMB7	Q99436	277 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	KIF1B	O60333	1816 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	IDE	P14735	1019 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SPIN3-231	ENST00000639895	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		12.8	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms