RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000634658.1

HCN1-202, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HCN1, Length 4,738 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN1-202ENST00000634658 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.32■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 ANKRD62A6NC57 917 aa22.31■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 PHKG2P15735 406 aa22.31■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.31■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.31■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.31■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.31■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 RIMBP2O15034 1052 aa22.31■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 PLA2R1Q13018 1463 aa22.31■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 KRT79Q5XKE5 535 aa22.31■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.31■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 DESP17661 470 aa22.3■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 GNA11P29992 359 aa22.3■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 ANO1Q5XXA6 986 aa22.3■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.3■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 BRD1O95696 1058 aa22.3■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 TCIRG1Q13488 830 aa22.3■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 TRAF1Q13077 416 aa22.3■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.3■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.29■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.29■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 V9GYY5 206 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 MYL5Q02045 173 aa22.29■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.29■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 PLIN2Q99541 437 aa22.29■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 MYL10Q9BUA6 226 aa22.29■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.29■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 A0A0D9SFI3 127 aa22.29■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.29■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.29■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 ELP1O95163 1332 aa22.28■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 ZNF445P59923 1031 aa22.28■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 PTH1RQ03431 593 aa22.28■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 ZNF174Q15697 407 aa22.28■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 SPECC1Q5M775 1068 aa22.28■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 CNBD1Q8NA66 436 aa22.28■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 POTEB2H3BUK9 544 aa22.28■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.28■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.28■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.28■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.28■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 DEXIO95424 95 aa22.28■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 ME3Q16798 604 aa22.28■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 TEX11Q8IYF3 940 aa22.28■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 IFFO1Q0D2I5 559 aa22.27■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 CCDC175P0C221 793 aa22.27■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.27■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.27■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 PHKBQ93100 1093 aa22.27■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.27■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 DRC1Q96MC2 740 aa22.27■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.27■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 MYOM2P54296 1465 aa22.27■■□□□ 1.16
HCN1-202ENST00000634658 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.27■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.26■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.26■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 TTC6Q86TZ1 520 aa22.26■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 PROSER3Q2NL68 480 aa22.25■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.25■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.25■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 E7EWF7 191 aa22.25■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.25■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.25■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.25■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 KDRP35968 1356 aa22.25■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.25■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 PKP1Q13835 747 aa22.25■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.25■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 SLU7O95391 586 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 LETM2Q2VYF4 491 aa22.24■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 GOPCQ9HD26 462 aa22.24■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa22.24■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.24■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 UFL1O94874 794 aa22.24■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 DYDC1Q8WWB3 177 aa22.24■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.24■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 SPATA5Q8NB90 893 aa22.23■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 VEZTQ9HBM0 779 aa22.23■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.23■■□□□ 1.15
HCN1-202ENST00000634658 ARFGAP3Q9NP61 516 aa22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms