RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 CRKP46108 304 aa34.63■■■■□ 3.13
CAPNS1-217ENST00000629983 GTF2A2P52657 109 aa34.63■■■■□ 3.13
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
CAPNS1-217ENST00000629983 MS4A4AQ96JQ5 239 aa34.63■■■■□ 3.13
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GUL6 1792 aa34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP3K9P80192 1104 aa34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-217ENST00000629983 CAP1Q01518 475 aa34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-217ENST00000629983 VGLL4Q14135 290 aa34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-217ENST00000629983 OTUD5Q96G74 571 aa34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-217ENST00000629983 HTTP42858 3142 aa34.61■■■■□ 3.13
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC4A10Q6U841 1118 aa34.61■■■■□ 3.13
CAPNS1-217ENST00000629983 TEPSINQ96N21 525 aa34.61■■■■□ 3.13
CAPNS1-217ENST00000629983 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
CAPNS1-217ENST00000629983 NBPF11Q86T75 865 aa34.6■■■■□ 3.13
CAPNS1-217ENST00000629983 VPS37DQ86XT2 251 aa34.6■■■■□ 3.13
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
CAPNS1-217ENST00000629983 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa34.6■■■■□ 3.13
CAPNS1-217ENST00000629983 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa34.59■■■■□ 3.13
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF333Q96JL9 665 aa34.59■■■■□ 3.13
CAPNS1-217ENST00000629983 LAMB1P07942 1786 aa34.59■■■■□ 3.13
CAPNS1-217ENST00000629983 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP34.58■■■■□ 3.138e-20■■□□□ 14.3
CAPNS1-217ENST00000629983 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-217ENST00000629983 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-217ENST00000629983 MYCP01106 439 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.12
CAPNS1-217ENST00000629983 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP34.57■■■■□ 3.12
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR63Q8IWG1 891 aa34.57■■■■□ 3.12
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM43AQ8N2R8 423 aa34.57■■■■□ 3.12
CAPNS1-217ENST00000629983 OTOFQ9HC10 1997 aa34.56■■■■□ 3.12
CAPNS1-217ENST00000629983 ALDH1L1O75891 902 aa34.55■■■■□ 3.12
CAPNS1-217ENST00000629983 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa34.55■■■■□ 3.12
CAPNS1-217ENST00000629983 CACNB3P54284 484 aa34.54■■■■□ 3.12
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF22Q14807 665 aa34.54■■■■□ 3.12
CAPNS1-217ENST00000629983 SUCLG2Q96I99 432 aa34.54■■■■□ 3.12
CAPNS1-217ENST00000629983 MRS2Q9HD23 443 aa34.54■■■■□ 3.12
CAPNS1-217ENST00000629983 TMOD2Q9NZR1 351 aa34.54■■■■□ 3.12
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
CAPNS1-217ENST00000629983 GRIK5Q16478 980 aa34.53■■■■□ 3.12
CAPNS1-217ENST00000629983 MROH5Q6ZUA9 1318 aa34.53■■■■□ 3.12
CAPNS1-217ENST00000629983 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.12
CAPNS1-217ENST00000629983 SPDYE5A6NIY4 337 aa34.51■■■■□ 3.12
CAPNS1-217ENST00000629983 CETPP11597 493 aa34.51■■■■□ 3.12
CAPNS1-217ENST00000629983 CAVIN4Q5BKX8 364 aa34.51■■■■□ 3.12
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa34.51■■■■□ 3.12
CAPNS1-217ENST00000629983 TEKT1Q969V4 418 aa34.51■■■■□ 3.12
CAPNS1-217ENST00000629983 WRNIP1Q96S55 665 aa34.51■■■■□ 3.12
CAPNS1-217ENST00000629983 METTL24Q5JXM2 366 aa34.5■■■■□ 3.11
CAPNS1-217ENST00000629983 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa34.49■■■■□ 3.11
CAPNS1-217ENST00000629983 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa34.49■■■■□ 3.11
CAPNS1-217ENST00000629983 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
CAPNS1-217ENST00000629983 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP34.48■■■■□ 3.11
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXO33Q7Z6M2 555 aa34.48■■■■□ 3.11
CAPNS1-217ENST00000629983 ERO1BQ86YB8 467 aa34.48■■■■□ 3.11
CAPNS1-217ENST00000629983 SH3TC2Q8TF17 1288 aa34.48■■■■□ 3.11
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa34.48■■■■□ 3.11
CAPNS1-217ENST00000629983 CACNA1FO60840 1977 aa34.48■■■■□ 3.11
CAPNS1-217ENST00000629983 TLR2O60603 784 aa34.47■■■■□ 3.11
CAPNS1-217ENST00000629983 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
CAPNS1-217ENST00000629983 SNAPC2Q13487 334 aa34.47■■■■□ 3.11
CAPNS1-217ENST00000629983 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
CAPNS1-217ENST00000629983 HOOK2Q96ED9 719 aa34.47■■■■□ 3.11
CAPNS1-217ENST00000629983 BTBD19C9JJ37 291 aa34.46■■■■□ 3.11
CAPNS1-217ENST00000629983 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
CAPNS1-217ENST00000629983 ARAP2Q8WZ64 1704 aa34.45■■■■□ 3.11
CAPNS1-217ENST00000629983 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
CAPNS1-217ENST00000629983 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP34.45■■■■□ 3.11
CAPNS1-217ENST00000629983 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
CAPNS1-217ENST00000629983 KAZALD1Q96I82 304 aa34.45■■■■□ 3.11
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC24Q50LG9 513 aa34.44■■■■□ 3.1
CAPNS1-217ENST00000629983 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
CAPNS1-217ENST00000629983 CENPFP49454 3210 aa34.43■■■■□ 3.1
CAPNS1-217ENST00000629983 IRF6O14896 467 aa34.43■■■■□ 3.1
CAPNS1-217ENST00000629983 DCAF15Q66K64 600 aa34.43■■■■□ 3.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
CAPNS1-217ENST00000629983 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
CAPNS1-217ENST00000629983 MAST3O60307 1309 aa34.43■■■■□ 3.1
CAPNS1-217ENST00000629983 PPIL2Q13356 520 aa34.42■■■■□ 3.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ZDHHC15Q96MV8 337 aa34.42■■■■□ 3.1
CAPNS1-217ENST00000629983 BCAMP50895 628 aa34.41■■■■□ 3.1
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM83AQ86UY5 434 aa34.41■■■■□ 3.1
CAPNS1-217ENST00000629983 PDE8BO95263 885 aa34.39■■■■□ 3.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF341Q9BYN7 854 aa34.39■■■■□ 3.1
CAPNS1-217ENST00000629983 GNRH1P01148 92 aa34.38■■■■□ 3.09
CAPNS1-217ENST00000629983 PRMT2P55345 433 aa34.38■■■■□ 3.09
CAPNS1-217ENST00000629983 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
CAPNS1-217ENST00000629983 MIGA2Q7L4E1 593 aa34.38■■■■□ 3.09
CAPNS1-217ENST00000629983 CPA4Q9UI42 421 aa34.38■■■■□ 3.09
CAPNS1-217ENST00000629983 FKBP1CQ5VVH2 108 aa34.37■■■■□ 3.09
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP34.37■■■■□ 3.09
CAPNS1-217ENST00000629983 H0YGN5 161 aa34.36■■■■□ 3.09
CAPNS1-217ENST00000629983 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
CAPNS1-217ENST00000629983 PPATQ06203 517 aa34.36■■■■□ 3.09
CAPNS1-217ENST00000629983 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD44Q8N8A2 993 aa34.36■■■■□ 3.09
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHDC4Q8TBB5 520 aa34.36■■■■□ 3.09
CAPNS1-217ENST00000629983 MRIQ9BWK5 157 aa34.36■■■■□ 3.09
CAPNS1-217ENST00000629983 UTYO14607 1347 aa34.35■■■■□ 3.09
CAPNS1-217ENST00000629983 VGLL2Q8N8G2 317 aa34.35■■■■□ 3.09
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