RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617053.2

PNMA8C-201, Transcript of PNMA family member 8C, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene PNMA8C, Length 4,255 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8C-201ENST00000617053 NWD1Q149M9 1564 aa10.73□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 POTEAQ6S8J7 498 aa10.73□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 KBTBD3Q8NAB2 608 aa10.73□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 FAM13BQ9NYF5 915 aa10.73□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 DLG5Q8TDM6 1919 aa10.73□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 OFD1O75665 1012 aa10.73□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 JMYQ8N9B5 988 aa10.73□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 A0A0D9SFI3 127 aa10.73□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 C21orf2O43822 256 aa10.73□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 HOMER1Q86YM7 354 aa10.73□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 USP25Q9UHP3 1055 aa10.73□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 STX8Q9UNK0 236 aa10.73□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 ATP10DQ9P241 1426 aa10.73□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 H7C1W4 665 aa10.72□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 CTSWP56202 376 aa10.72□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 SUSD4Q5VX71 490 aa10.72□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 PRC1O43663 620 aa10.72□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 SMC2O95347 1197 aa10.72□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 CHRNA5P30532 468 aa10.72□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 ADORA1P30542 326 aa10.72□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP10.72□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 TCP10Q12799 353 aa10.72□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 KIAA0825Q8IV33 1275 aa10.72□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 MBD4O95243 580 aa10.72□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 ATP5JP18859 108 aa10.72□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 GTF2IP78347 998 aa10.72□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 ZHX3Q9H4I2 956 aa10.72□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 TSPY2A6NKD2 308 aa10.72□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 IARSP41252 1262 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 ITPK1Q13572 414 aa10.72□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 RGS12O14924 1447 aa10.71□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 RPS6KB1P23443 525 aa10.71□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 TBC1D9BQ66K14 1250 aa10.71□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 DBNDD1Q9H9R9 158 aa10.71□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 LMBRD1Q9NUN5 540 aa10.71□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 GGA1Q9UJY5 639 aa10.71□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 A0A0G2JLW4 131 aa10.71□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP10.71□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 TPM3P06753 285 aa10.71□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 SCNN1DP51172 638 aa10.71□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 KLHL10Q6JEL2 608 aa10.71□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 RASEFQ8IZ41 740 aa10.71□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 SLC26A6Q9BXS9 759 aa10.71□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
PNMA8C-201ENST00000617053 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 OLFM4Q6UX06 510 aa10.71□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 PI4K2BQ8TCG2 481 aa10.71□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 RAD17O75943 681 aa10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 BRD1O95696 1058 aa10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 MTX1Q13505 466 aa10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 FEZ1Q99689 392 aa10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 GPAA1O43292 621 aa10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 RBM10P98175 930 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 JAK2O60674 1132 aa10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 RPS6KA4O75676 772 aa10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 BAG3O95817 575 aa10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 LDHCP07864 332 aa10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 BCAMP50895 628 aa10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 ADCK5Q3MIX3 580 aa10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 SOGA3Q5TF21 947 aa10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 LPIN2Q92539 896 aa10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 WASF1Q92558 559 aa10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 ARMT1Q9H993 441 aa10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 HELLSQ9NRZ9 838 aa10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 ZBTB43O43298 467 aa10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 CATIPQ7Z7H3 387 aa10.7□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 EIF6P56537 245 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 ZNF445P59923 1031 aa10.69□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 WTAPQ15007 396 aa10.69□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 FLAD1Q8NFF5 587 aa10.69□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 TM6SF1Q9BZW5 370 aa10.69□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 ZNF804AQ7Z570 1209 aa10.69□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 CEP57L1Q8IYX8 460 aa10.69□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 APPBP2Q92624 585 aa10.69□□□□□ -0.7
PNMA8C-201ENST00000617053 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms