RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614197.4

NPIPB4-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-222	ENST00000614197	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZIC5	Q96T25	663 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	MEIS3	Q99687	375 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	SRGAP3	O43295	1099 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	GNAI2	P04899	355 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	FGFR2	P21802	821 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	HOOK2	Q96ED9	719 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	CSRNP1	Q96S65	589 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	RNF186	Q9NXI6	227 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	UNCX	A6NJT0	531 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRIM27	P14373	513 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	COPRS	Q9NQ92	184 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPIPB4-222	ENST00000614197	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	SEMA3E	O15041	775 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	BCAR3	O75815	825 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	GORAB	Q5T7V8	394 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	ABHD8	Q96I13	439 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	MRI	Q9BWK5	157 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	INHBE	P58166	350 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	DGKZ	Q13574	1117 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	ALDH1A1	P00352	501 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAP3K11	Q16584	847 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	SPRYD7	Q5W111	196 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLF2	Q8IX21	1173 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	CSAD	Q9Y600	493 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	MTX1	Q13505	466 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197		A0A1B0GUL6	1792 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	MS4A1	P11836	297 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	TM4SF4	P48230	202 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	DCAF15	Q66K64	600 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCDC102B	Q68D86	513 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	WNK4	Q96J92	1243 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197		A0A1B0GUL7	405 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	PHKA1	P46020	1223 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	TFCP2	Q12800	502 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	GRIK5	Q16478	980 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM83A	Q86UY5	434 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	FZD1	Q9UP38	647 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NPIPB4-222	ENST00000614197	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	TBC1D8	O95759	1140 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	CACNB3	P54284	484 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	TIMM10	P62072	90 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAP3K9	P80192	1104 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	XAGE2	Q96GT9	111 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	ELP3	Q9H9T3	547 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	ABCF2	Q9UG63	623 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	PCNT	O95613	3336 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	AOX1	Q06278	1338 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	ADORA1	P30542	326 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	FKTN	O75072	461 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRDX5	P30044	214 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	GSTO1	P78417	241 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NPIPB4-222	ENST00000614197	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25

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