RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BCORQ6W2J9 1755 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MBD4O95243 580 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM87BQ96K49 555 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NAPBQ9H115 298 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DACT1Q9NYF0 836 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RCOR1Q9UKL0 485 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FOSBP53539 338 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RGS22Q8NE09 1264 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PGBD1Q96JS3 809 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TNMDQ9H2S6 317 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UBE4AQ14139 1066 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LRP2BPQ9P2M1 347 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C8orf76Q96K31 380 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NYXQ9GZU5 481 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CLSTN2Q9H4D0 955 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ARMT1Q9H993 441 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CDKL5O76039 1030 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DOCK2Q92608 1830 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 B4E1Z4 1266 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RPS6KA4O75676 772 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GUCY1B3Q02153 619 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CAMK4Q16566 473 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NARFQ9UHQ1 456 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KRT23Q9C075 422 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PPFIA3O75145 1194 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KDM4AO75164 1064 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PTMAP06454 111 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP28Q96RU2 1077 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NR1I2O75469 434 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BRAPQ7Z569 592 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP25Q9UHP3 1055 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NEDD4P46934 1319 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TDO2P48775 406 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KCNQ4P56696 695 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TYRO3Q06418 890 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SETDB2Q96T68 719 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZPR1O75312 459 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LIFRP42702 1097 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 APOA5Q6Q788 366 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LCORLQ8N3X6 602 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 VPS37DQ86XT2 251 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NLRP3Q96P20 1036 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP21Q9UK80 565 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZBTB43O43298 467 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ADCY5O95622 1261 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CYP7A1P22680 504 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SASS6Q6UVJ0 657 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CTAGE5O15320 804 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GYG1P46976 350 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CKAP2LQ8IYA6 745 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms