RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 USP17L4A6NCW7 530 aa9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 DNAAF4Q8WXU2 420 aa9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 MXD3Q9BW11 206 aa9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 DEFB129Q9H1M3 183 aa9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 WDFY4Q6ZS81 3184 aa9.8□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 PI4KAP2A4QPH2 592 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 TNFRSF10AO00220 468 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 TLR2O60603 784 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 UFL1O94874 794 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 SGPL1O95470 568 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 GRK4P32298 578 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 CCT4P50991 539 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 PODNQ7Z5L7 613 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 CCDC191Q8NCU4 936 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 RNF208Q9H0X6 261 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 SRRDQ9UH36 339 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 IRS2Q9Y4H2 1338 aa9.79□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 USP2O75604 605 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 LINS1Q8NG48 757 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 TRIM47Q96LD4 638 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 LTBP2Q14767 1821 aa9.77□□□□□ -0.84
ZNF548-208ENST00000597576 ALDH1L1O75891 902 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 RPS8P62241 208 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 SLC4A10Q6U841 1118 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 OPTNQ96CV9 577 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 SNX27Q96L92 541 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 MYD88Q99836 296 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 MYH3P11055 1940 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 CHD7Q9P2D1 2997 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 ADGRA2Q96PE1 1338 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 MYO9BQ13459 2157 aa9.77□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 USP34Q70CQ2 3546 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 OSBPP22059 807 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 MMP14P50281 582 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 MAP3K12Q12852 859 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 CCL15Q16663 113 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 C17orf99Q6UX52 265 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 G2E3Q7L622 706 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 ISCA1Q9BUE6 129 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 GGA1Q9UJY5 639 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF804BA4D1E1 1349 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 MYO3BQ8WXR4 1341 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 MAST2Q6P0Q8 1798 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 BCAR3O75815 825 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 STRIP1Q5VSL9 837 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 C7orf61Q8IZ16 206 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 OGFOD1Q8N543 542 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 FAM161BQ96MY7 647 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 ELP3Q9H9T3 547 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 AK9Q5TCS8 1911 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 CFAP54Q96N23 3096 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 AOX1Q06278 1338 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 FAM205AQ6ZU69 1335 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 TRANK1O15050 2925 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 MED23Q9ULK4 1368 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 A0A1B0GUL6 1792 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 NEURL1BA8MQ27 555 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa9.74□□□□□ -0.85
ZNF548-208ENST00000597576 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms