RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591307.5

BECN1-218, Transcript of beclin 1, humanhuman

TSL 2

Gene BECN1, Length 744 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1-218ENST00000591307 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
BECN1-218ENST00000591307 POLA2Q14181 598 aa21.99■■□□□ 1.11
BECN1-218ENST00000591307 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.99■■□□□ 1.11
BECN1-218ENST00000591307 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.99■■□□□ 1.11
BECN1-218ENST00000591307 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.99■■□□□ 1.11
BECN1-218ENST00000591307 A0A1B0GUL7 405 aa21.98■■□□□ 1.11
BECN1-218ENST00000591307 SLC10A3P09131 477 aa21.98■■□□□ 1.11
BECN1-218ENST00000591307 FKBP1BP68106 108 aa21.98■■□□□ 1.11
BECN1-218ENST00000591307 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
BECN1-218ENST00000591307 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
BECN1-218ENST00000591307 CCDC102BQ68D86 513 aa21.98■■□□□ 1.11
BECN1-218ENST00000591307 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.98■■□□□ 1.11
BECN1-218ENST00000591307 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.98■■□□□ 1.11
BECN1-218ENST00000591307 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.97■■□□□ 1.11
BECN1-218ENST00000591307 NOGQ13253 232 aa21.97■■□□□ 1.11
BECN1-218ENST00000591307 RASA3Q14644 834 aa21.97■■□□□ 1.11
BECN1-218ENST00000591307 IFFO2Q5TF58 517 aa21.97■■□□□ 1.11
BECN1-218ENST00000591307 SSH3Q8TE77 659 aa21.97■■□□□ 1.11
BECN1-218ENST00000591307 CCDC102AQ96A19 550 aa21.97■■□□□ 1.11
BECN1-218ENST00000591307 XAGE2Q96GT9 111 aa21.97■■□□□ 1.11
BECN1-218ENST00000591307 MYO1BO43795 1136 aa21.96■■□□□ 1.11
BECN1-218ENST00000591307 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
BECN1-218ENST00000591307 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.95■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 PRDX5P30044 214 aa21.95■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 CACNB3P54284 484 aa21.95■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.95■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 CSRNP1Q96S65 589 aa21.95■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.95■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 NF2P35240 595 aa21.94■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 LDLRAD1Q5T700 205 aa21.94■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 TEKT1Q969V4 418 aa21.94■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 ZDHHC15Q96MV8 337 aa21.94■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 TEPSINQ96N21 525 aa21.94■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.94■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 MRIQ9BWK5 157 aa21.94■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.94■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 RASGRF1Q13972 1273 aa21.93■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 DIXDC1Q155Q3 683 aa21.93■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.93■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 TNS4Q8IZW8 715 aa21.92■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.92■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 BEGAINQ9BUH8 593 aa21.92■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.92■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.92■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.92■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.92■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.91■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.91■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 COG6Q9Y2V7 657 aa21.91■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 SURF6O75683 361 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.9■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 CEP85Q6P2H3 762 aa21.9■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 PI16Q6UXB8 463 aa21.9■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21.9■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.89■■□□□ 1.1
BECN1-218ENST00000591307 SEMA3EO15041 775 aa21.89■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 ZBTB22O15209 634 aa21.89■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 LDHBP07195 334 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 MAP3K11Q16584 847 aa21.89■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.89■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa21.88■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 RNF186Q9NXI6 227 aa21.88■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.88■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 MAST3O60307 1309 aa21.87■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 TRPA1O75762 1119 aa21.87■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa21.87■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa21.87■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 ZNF384Q8TF68 577 aa21.87■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.87■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 TNFAIP1Q13829 316 aa21.86■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 TNNI3KQ59H18 835 aa21.86■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.86■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 ABCF2Q9UG63 623 aa21.86■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa21.86■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.85■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 GJA5P36382 358 aa21.85■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 NFIAQ12857 509 aa21.85■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 GORABQ5T7V8 394 aa21.85■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 SPRYD7Q5W111 196 aa21.85■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.85■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.85■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.84■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 CA12O43570 354 aa21.84■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 MCAMP43121 646 aa21.84■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 ZFPM1Q8IX07 1006 aa21.84■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 GPR108Q9NPR9 543 aa21.84■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms