RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-218	ENST00000584243	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	ABCC4	O15439	1325 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	NF2	P35240	595 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	RIPK4	P57078	832 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	SHH	Q15465	462 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	HLF	Q16534	295 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	PFAS	O15067	1338 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		10.02	□□□□□ -0.8
GGA3-218	ENST00000584243	PRR33	A8MZF0	331 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	ECE2	O60344	883 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	TLR2	O60603	784 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	KCNQ1	P51787	676 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	TFF2	Q03403	129 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	C8orf34	Q49A92	452 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	SP8	Q8IXZ3	490 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	IL27	Q8NEV9	243 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	ANKS1A	Q92625	1134 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	GML	Q99445	158 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	POLK	Q9UBT6	870 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	MYPN	Q86TC9	1320 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	ITGB8	P26012	769 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	PSMC4	P43686	418 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	PRKCZ	Q05513	592 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	NEUROD2	Q15784	382 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	DOK7	Q18PE1	504 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	COG6	Q9Y2V7	657 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		10	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	INHA	P05111	366 aa		10	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	KIF22	Q14807	665 aa		10	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		10	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	NBPF3	Q9H094	633 aa		10	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	GABRQ	Q9UN88	632 aa		10	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		10	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	USP24	Q9UPU5	2620 aa		10	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	LTBP2	Q14767	1821 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	RIMBP2	O15034	1052 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	ELN	P15502	786 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	CAPN2	P17655	700 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	PRKAR2B	P31323	418 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	IL13	P35225	146 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		9.99	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	ADGRE1	Q14246	886 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	WASHC4	Q2M389	1173 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	C17orf99	Q6UX52	265 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	PODN	Q7Z5L7	613 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	SMC5	Q8IY18	1101 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	PANK1	Q8TE04	598 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	NECTIN2	Q92692	538 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	CD320	Q9NPF0	282 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	OTOF	Q9HC10	1997 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	WNT10B	O00744	389 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	TRIM27	P14373	513 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	RGS3	P49796	1198 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	CCL15	Q16663	113 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	KCNH6	Q9H252	994 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	POLL	Q9UGP5	575 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
GGA3-218	ENST00000584243	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
GGA3-218	ENST00000584243	USP17L8	P0C7I0	530 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GGA3-218	ENST00000584243	ZNF853	P0CG23	659 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GGA3-218	ENST00000584243	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
GGA3-218	ENST00000584243	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GGA3-218	ENST00000584243	OPTN	Q96CV9	577 aa		9.96	□□□□□ -0.82
GGA3-218	ENST00000584243	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82

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