RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576346.5

NSF-208, Transcript of N-ethylmaleimide sensitive factor, vesicle fusing ATPase, human

TSL 4

Gene NSF, Length 710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSF-208	ENST00000576346	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	COL8A1	P27658	744 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	BAG6	P46379	1132 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	POU4F2	Q12837	409 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	CASC1	Q6TDU7	716 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	STK32A	Q8WU08	396 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	XAGE2	Q96GT9	111 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	PTPRC	P08575	1304 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	ARHGEF10	O15013	1369 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346		A6NJY4	79 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	F11	P03951	625 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	MCM4	P33991	863 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	MRE11	P49959	708 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	SCNN1D	P51172	638 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	SMTN	P53814	917 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	CENPC	Q03188	943 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	TLR1	Q15399	786 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	COG3	Q96JB2	828 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	CDK19	Q9BWU1	502 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	MTMR7	Q9Y216	660 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	KIAA0232	Q92628	1395 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	HMMR	O75330	724 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	CDC45	O75419	566 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	IL2RA	P01589	272 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	ZNF853	P0CG23	659 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	PRKAR2B	P31323	418 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	KLRG1	Q96E93	195 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	STK26	Q9P289	416 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	USP54	Q70EL1	1684 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	LRRC37A3	O60309	1634 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	CDK2AP1	O14519	115 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	PRMT3	O60678	531 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	DKK1	O94907	266 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	BRD1	O95696	1058 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	ATP2B4	P23634	1241 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	RABEP1	Q15276	862 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346		Q8N3U1	123 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NSF-208	ENST00000576346	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67

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