RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573667.1

ABR-222, Transcript of ABR, RhoGEF and GTPase activating protein, human

TSL 4

Gene ABR, Length 560 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABR-222	ENST00000573667	SLC10A3	P09131	477 aa		14.79	□□□□□ -0.04
ABR-222	ENST00000573667	MS4A1	P11836	297 aa		14.79	□□□□□ -0.04
ABR-222	ENST00000573667	LBX1	P52954	281 aa		14.79	□□□□□ -0.04
ABR-222	ENST00000573667	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
ABR-222	ENST00000573667	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	14.79	□□□□□ -0.04
ABR-222	ENST00000573667	PRKG1	Q13976	671 aa		14.79	□□□□□ -0.04
ABR-222	ENST00000573667	TNS4	Q8IZW8	715 aa		14.79	□□□□□ -0.04
ABR-222	ENST00000573667	OTOF	Q9HC10	1997 aa		14.78	□□□□□ -0.04
ABR-222	ENST00000573667	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		14.78	□□□□□ -0.04
ABR-222	ENST00000573667	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
ABR-222	ENST00000573667	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		14.78	□□□□□ -0.04
ABR-222	ENST00000573667	SEMA3E	O15041	775 aa		14.78	□□□□□ -0.04
ABR-222	ENST00000573667	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
ABR-222	ENST00000573667	TNNI2	P48788	182 aa		14.78	□□□□□ -0.04
ABR-222	ENST00000573667	TFCP2	Q12800	502 aa		14.78	□□□□□ -0.04
ABR-222	ENST00000573667	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		14.78	□□□□□ -0.04
ABR-222	ENST00000573667	MOB2	Q70IA6	237 aa		14.78	□□□□□ -0.04
ABR-222	ENST00000573667	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
ABR-222	ENST00000573667	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
ABR-222	ENST00000573667	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		14.78	□□□□□ -0.04
ABR-222	ENST00000573667	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		14.78	□□□□□ -0.04
ABR-222	ENST00000573667	LAMB1	P07942	1786 aa		14.78	□□□□□ -0.04
ABR-222	ENST00000573667		A0A1B0GUL7	405 aa		14.77	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	TIMM10	P62072	90 aa		14.77	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	GRIK5	Q16478	980 aa		14.77	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		14.77	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		14.77	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		14.77	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	RLBP1	P12271	317 aa		14.76	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	PHKA1	P46020	1223 aa		14.76	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	RASA3	Q14644	834 aa		14.76	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	CCDC102B	Q68D86	513 aa		14.76	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		14.76	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	MRI	Q9BWK5	157 aa		14.76	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		14.76	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		14.75	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	ADORA1	P30542	326 aa		14.75	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	ATP8B2	P98198	1209 aa		14.75	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	GORAB	Q5T7V8	394 aa		14.75	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		14.75	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	XAGE2	Q96GT9	111 aa		14.75	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		14.75	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	ZIC5	Q96T25	663 aa		14.75	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	AOX1	Q06278	1338 aa		14.74	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		14.74	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	PANK1	Q8TE04	598 aa		14.74	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	TSKS	Q9UJT2	592 aa		14.74	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		14.74	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	DOCK2	Q92608	1830 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	PRDX5	P30044	214 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	POLA2	Q14181	598 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	SSH3	Q8TE77	659 aa		14.73	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	ZBTB22	O15209	634 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	MAP3K11	Q16584	847 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	CSRNP1	Q96S65	589 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	ABCF2	Q9UG63	623 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	FZD1	Q9UP38	647 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		14.72	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	UNCX	A6NJT0	531 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	CACNB3	P54284	484 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	RASGRF1	Q13972	1273 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	SLF2	Q8IX21	1173 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	HOOK2	Q96ED9	719 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		14.71	□□□□□ -0.05
ABR-222	ENST00000573667	TRPA1	O75762	1119 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ABR-222	ENST00000573667	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ABR-222	ENST00000573667	SREBF2	Q12772	1141 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ABR-222	ENST00000573667	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ABR-222	ENST00000573667	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ABR-222	ENST00000573667	FAM83A	Q86UY5	434 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ABR-222	ENST00000573667	GPR108	Q9NPR9	543 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ABR-222	ENST00000573667	RNF186	Q9NXI6	227 aa		14.7	□□□□□ -0.06
ABR-222	ENST00000573667	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		14.7	□□□□□ -0.06

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