RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571386.1

SPNS2-204, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPNS2, Length 846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-204ENST00000571386 ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.67■□□□□ 0.9
SPNS2-204ENST00000571386 CIAO1O76071 339 aa20.67■□□□□ 0.9
SPNS2-204ENST00000571386 CFAP100Q494V2 611 aa20.67■□□□□ 0.9
SPNS2-204ENST00000571386 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.67■□□□□ 0.9
SPNS2-204ENST00000571386 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.67■□□□□ 0.9
SPNS2-204ENST00000571386 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.67■□□□□ 0.9
SPNS2-204ENST00000571386 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
SPNS2-204ENST00000571386 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
SPNS2-204ENST00000571386 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.66■□□□□ 0.9
SPNS2-204ENST00000571386 LPIN2Q92539 896 aa20.66■□□□□ 0.9
SPNS2-204ENST00000571386 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.66■□□□□ 0.9
SPNS2-204ENST00000571386 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.66■□□□□ 0.9
SPNS2-204ENST00000571386 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
SPNS2-204ENST00000571386 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
SPNS2-204ENST00000571386 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
SPNS2-204ENST00000571386 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
SPNS2-204ENST00000571386 PRKG1Q13976 671 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS2-204ENST00000571386 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS2-204ENST00000571386 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
SPNS2-204ENST00000571386 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS2-204ENST00000571386 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 SRGAP3O43295 1099 aa20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 SPDYE6P0CI01 402 aa20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 BCAMP50895 628 aa20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 GNAI2P04899 355 aa20.63■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 FGFR2P21802 821 aa20.63■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 ATP2B3Q16720 1220 aa20.63■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 SPRYD7Q5W111 196 aa20.63■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.63■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 VEZTQ9HBM0 779 aa20.63■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 COPRSQ9NQ92 184 aa20.63■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 TRIM17Q9Y577 477 aa20.63■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.63■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 POTEFA5A3E0 1075 aa20.62■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 ALDH1A1P00352 501 aa20.62■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 CLRN2A0PK11 232 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 TNFAIP1Q13829 316 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 MAST3O60307 1309 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 SZT2Q5T011 3432 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 OTOFQ9HC10 1997 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 MTX1Q13505 466 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 FZD1Q9UP38 647 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 TNNQ9UQP3 1299 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 CRKP46108 304 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 TEKT1Q969V4 418 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.58■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 IFNL1Q8IU54 200 aa20.58■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SPNS2-204ENST00000571386 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.57■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 TNNI2P48788 182 aa20.56■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.56■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 SEMA3EO15041 775 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 INHBEP58166 350 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 RASA3Q14644 834 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 WNK4Q96J92 1243 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 GRIK5Q16478 980 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 ERO1AQ96HE7 468 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 MRIQ9BWK5 157 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 TFCP2Q12800 502 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 MAP3K11Q16584 847 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 ZDHHC15Q96MV8 337 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 CEP290O15078 2479 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 AOX1Q06278 1338 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 A0A1B0GUL7 405 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 MS4A1P11836 297 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 PHKA1P46020 1223 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-204ENST00000571386 CRHR2Q13324 411 aa20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms