RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557130.1

UBE2CP1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP1, Length 554 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP1-201ENST00000557130 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 PLA2G4DQ86XP0 818 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 CKAP2LQ8IYA6 745 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 KCNG4Q8TDN1 519 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 C8orf76Q96K31 380 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 USP28Q96RU2 1077 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 SGIP1Q9BQI5 828 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 ANO10Q9NW15 660 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 HPS5Q9UPZ3 1129 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZMYM6O95789 1325 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 CARMIL3Q8ND23 1372 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 CPLX1O14810 134 aa8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 MCAMP43121 646 aa8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 ME1P48163 572 aa8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 MAP3K12Q12852 859 aa8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 IQCB1Q15051 598 aa8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 STX1AQ16623 288 aa8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 PARP10Q53GL7 1025 aa8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 CCDC102BQ68D86 513 aa8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 LINC00301Q8NCQ3 95 aa8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 TIGD1Q96MW7 591 aa8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 SHANK3Q9BYB0 1731 aa8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 ATRNO75882 1429 aa8.97□□□□□ -0.97
UBE2CP1-201ENST00000557130 LRP6O75581 1613 aa8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 A0A0G2JLW4 131 aa8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 SLC5A1P13866 664 aa8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 PDE6AP16499 860 aa8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 GNAT2P19087 354 aa8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 CMA1P23946 247 aa8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 GPTP24298 496 aa8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 LIFRP42702 1097 aa8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 ANTXR2P58335 489 aa8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 CHST3Q7LGC8 479 aa8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 LUZP1Q86V48 1076 aa8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 SGMS1Q86VZ5 419 aa8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 SYNE4Q8N205 404 aa8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 TMTC2Q8N394 836 aa8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 FSIP1Q8NA03 581 aa8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 MYRIPQ8NFW9 859 aa8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 BPIFA3Q9BQP9 254 aa8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 TRIM5Q9C035 493 aa8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 PCDHA7Q9UN72 937 aa8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 RTL9Q8NET4 1388 aa8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 LAMA4Q16363 1823 aa8.96□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 STRCQ7RTU9 1775 aa8.95□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 UQCRHLA0A096LP55 91 aa8.95□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 GOLGA8BA8MQT2 603 aa8.95□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 SPTLC2O15270 562 aa8.95□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 UQCRHP07919 91 aa8.95□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 HAND2P61296 217 aa8.95□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 SLC39A14Q15043 492 aa8.95□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 PPP2R5BQ15173 497 aa8.95□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 STK38Q15208 465 aa8.95□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 POTEHQ6S545 545 aa8.95□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 JMYQ8N9B5 988 aa8.95□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 SPATA5Q8NB90 893 aa8.95□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa8.95□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 WASF1Q92558 559 aa8.95□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 SDF4Q9BRK5 362 aa8.95□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 KRT23Q9C075 422 aa8.95□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa8.95□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZNF532Q9HCE3 1301 aa8.95□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 RIC1Q4ADV7 1423 aa8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms