RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 KCNJ4P48050 445 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 CACNB3P54284 484 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 GRIK5Q16478 980 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 TRIM47Q96LD4 638 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 PI4KAP2A4QPH2 592 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 E9PSI1 815 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 MYO1BO43795 1136 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 TLR2O60603 784 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 GTF2A2P52657 109 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 SLFN5Q08AF3 891 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP17.57■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 ZBED9Q6R2W3 1325 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 OSBPP22059 807 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 PSMC4P43686 418 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 MAP3K9P80192 1104 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 G2E3Q7L622 706 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 TSPYL6Q8N831 410 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 CDCA7LQ96GN5 454 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 RNF208Q9H0X6 261 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 ECM29Q5VYK3 1845 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 IRF6O14896 467 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 GJA8P48165 433 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 SPDYE2Q495Y8 402 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 MPHOSPH8Q99549 860 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 UNC93B1Q9H1C4 597 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 UNCXA6NJT0 531 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 NEURL1BA8MQ27 555 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 H7C1W4 665 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 ARHGEF6Q15052 776 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 ANKRD2Q9GZV1 360 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 SRRDQ9UH36 339 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 GABRQQ9UN88 632 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 PLIN1O60240 522 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 GRK4P32298 578 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 MMP14P50281 582 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 KIF22Q14807 665 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 C17orf99Q6UX52 265 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 SPDYE5A6NIY4 337 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 GJB1P08034 283 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 IL1R1P14778 569 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 CASP7P55210 303 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 PRKCZQ05513 592 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 KSR2Q6VAB6 950 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 RAET1EQ8TD07 263 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 MYH3P11055 1940 aa17.51■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 CUL9Q8IWT3 2517 aa17.51■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 DEFB123Q8N688 67 aa17.51■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 HTATIP2Q9BUP3 242 aa17.51■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 CSADQ9Y600 493 aa17.51■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 MYPNQ86TC9 1320 aa17.5■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 EVI5O60447 810 aa17.5■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 NR2E3Q9Y5X4 410 aa17.5■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 DDX58O95786 925 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 CSF1RP07333 972 aa17.49■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 CETPP11597 493 aa17.49■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 ELNP15502 786 aa17.49■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 GYG1P46976 350 aa17.49■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 MFSD14BQ5SR56 506 aa17.49■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 MIGA2Q7L4E1 593 aa17.49■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 WRNIP1Q96S55 665 aa17.49■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 ADGRA2Q96PE1 1338 aa17.48■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 VAMP4O75379 141 aa17.48■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 INPP5BP32019 993 aa17.48■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 CRKP46108 304 aa17.48■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 ZNF804AQ7Z570 1209 aa17.48■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 CHMP4AQ9BY43 222 aa17.48■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 UNC80Q8N2C7 3258 aa17.48■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 PDHXO00330 501 aa17.47■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 CYP2C8P10632 490 aa17.47■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 SYN1P17600 705 aa17.47■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 SNAPC2Q13487 334 aa17.47■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 GCKRQ14397 625 aa17.47■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 ERO1BQ86YB8 467 aa17.47■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 A0A1B0GUL6 1792 aa17.46■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 SGPL1O95470 568 aa17.46■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 MOGSQ13724 837 aa17.46■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 TNFAIP1Q13829 316 aa17.46■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 EPHA10Q5JZY3 1008 aa17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms