RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	GRIK5	Q16478	980 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	14.27	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	14.27	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	MAST3	O60307	1309 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	14.26	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	14.26	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	MOB2	Q70IA6	237 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	TEKT1	Q969V4	418 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	CSRNP1	Q96S65	589 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	14.25	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	CLRN2	A0PK11	232 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	14.25	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	POLA2	Q14181	598 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	RASA3	Q14644	834 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	14.25	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	14.24	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	RLBP1	P12271	317 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	14.24	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	14.24	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	SSH3	Q8TE77	659 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	TEPSIN	Q96N21	525 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	VEZT	Q9HBM0	779 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137		A0A1B0GUL7	405 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	PHKA1	P46020	1223 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	TM4SF4	P48230	202 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	ATP8B2	P98198	1209 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	14.23	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	CCDC102B	Q68D86	513 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	FAM83A	Q86UY5	434 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	14.23	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	14.22	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	MS4A1	P11836	297 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	TNNI2	P48788	182 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	TIMM10	P62072	90 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	TFCP2	Q12800	502 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	GPR108	Q9NPR9	543 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	RNF186	Q9NXI6	227 aa		14.22	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	14.22	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	ADORA1	P30542	326 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	14.21	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	14.21	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	14.21	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	14.21	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	XAGE2	Q96GT9	111 aa		14.21	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	14.21	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	14.21	□□□□□ -0.13
CS-223	ENST00000551137	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	14.2	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	14.2	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	PRDX5	P30044	214 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	INHBE	P58166	350 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	RASGRF1	Q13972	1273 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	SPRYD7	Q5W111	196 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	PRKG1	Q13976	671 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	14.19	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	14.19	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	TSKS	Q9UJT2	592 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	14.19	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	TRPA1	O75762	1119 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	14.18	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	SREBF2	Q12772	1141 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	14.18	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	HOOK2	Q96ED9	719 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	FZD1	Q9UP38	647 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	LAMB1	P07942	1786 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	GAK	O14976	1311 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	WNK4	Q96J92	1243 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		14.17	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	14.16	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	IGSF3	O75054	1194 aa		14.16	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	14.16	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	CACNB3	P54284	484 aa		14.16	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	MAP3K9	P80192	1104 aa		14.16	□□□□□ -0.14
CS-223	ENST00000551137	CEP85	Q6P2H3	762 aa		14.16	□□□□□ -0.14

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