RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.84■■□□□ 1.73
CS-222ENST00000550996 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.83■■□□□ 1.73
CS-222ENST00000550996 ZBTB22O15209 634 aa25.83■■□□□ 1.73
CS-222ENST00000550996 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CS-222ENST00000550996 RASGRF1Q13972 1273 aa25.83■■□□□ 1.73
CS-222ENST00000550996 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.83■■□□□ 1.73
CS-222ENST00000550996 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CS-222ENST00000550996 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa25.83■■□□□ 1.73
CS-222ENST00000550996 MYO1BO43795 1136 aa25.82■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 MS4A1P11836 297 aa25.82■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 PRDX5P30044 214 aa25.82■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 FKBP1BP68106 108 aa25.82■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.81■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 SEMA3EO15041 775 aa25.81■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 MAP2K2P36507 400 aa25.81■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 TEKT1Q969V4 418 aa25.81■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.81■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 FZD1Q9UP38 647 aa25.81■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 ECM29Q5VYK3 1845 aa25.8■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 RASA3Q14644 834 aa25.8■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 ZDHHC15Q96MV8 337 aa25.8■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.8■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 MRIQ9BWK5 157 aa25.8■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.8■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.79■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.79■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.79■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 SLC10A3P09131 477 aa25.78■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 NOGQ13253 232 aa25.78■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 PRKG1Q13976 671 aa25.78■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 DIXDC1Q155Q3 683 aa25.78■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.78■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 MAST3O60307 1309 aa25.78■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 NF2P35240 595 aa25.77■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 CACNB3P54284 484 aa25.77■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 TNNI3KQ59H18 835 aa25.77■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 HHIPL2Q6UWX4 724 aa25.77■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 PI16Q6UXB8 463 aa25.77■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 AIDAQ96BJ3 306 aa25.77■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.77■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.77■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.76■■□□□ 1.72
CS-222ENST00000550996 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.76■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.76■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 CCDC102AQ96A19 550 aa25.76■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 TEPSINQ96N21 525 aa25.76■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 GPR108Q9NPR9 543 aa25.76■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa25.76■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.75■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 PDE3AQ14432 1141 aa25.74■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.74■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.74■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.74■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 TNFAIP1Q13829 316 aa25.73■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.73■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 MCAMP43121 646 aa25.72■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 GORABQ5T7V8 394 aa25.72■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.72■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 LBX1P52954 281 aa25.71■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 MAP3K11Q16584 847 aa25.71■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.71■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 SPATA5Q8NB90 893 aa25.71■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 ZNF384Q8TF68 577 aa25.71■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 TSKSQ9UJT2 592 aa25.71■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CS-222ENST00000550996 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa25.7■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 ABCF2Q9UG63 623 aa25.7■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 GAKO14976 1311 aa25.69■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.69■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa25.69■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 CLMNQ96JQ2 1002 aa25.69■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 CSRNP1Q96S65 589 aa25.68■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.68■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.67■■□□□ 1.7
CS-222ENST00000550996 TNNI2P48788 182 aa25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.9 ms