RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546956.1

AC008969.1-204, humanhuman

TSL 2

Gene AC008969.1, Length 1,096 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC008969.1-204ENST00000546956 G2E3Q7L622 706 aa15.46■□□□□ 0.07
AC008969.1-204ENST00000546956 SHISA4Q96DD7 197 aa15.46■□□□□ 0.07
AC008969.1-204ENST00000546956 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
AC008969.1-204ENST00000546956 APAF1O14727 1248 aa15.45■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 CSF1RP07333 972 aa15.45■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 GCKRQ14397 625 aa15.45■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 ARHGEF6Q15052 776 aa15.45■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.45■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 ZNF804AQ7Z570 1209 aa15.45■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 TEPSINQ96N21 525 aa15.45■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 MGAMO43451 1857 aa15.44■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 GTF2A2P52657 109 aa15.44■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 TNFAIP1Q13829 316 aa15.44■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 MTFR1Q15390 333 aa15.44■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 TMEM39BQ9GZU3 492 aa15.44■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 CUL9Q8IWT3 2517 aa15.43■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa15.43■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 TCP10L2B9ZVM9 353 aa15.43■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP15.43■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 DLL1O00548 723 aa15.42■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 TLR2O60603 784 aa15.42■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 MAP3K9P80192 1104 aa15.42■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 DPF3Q92784 378 aa15.42■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 STK31Q9BXU1 1019 aa15.42■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 CSADQ9Y600 493 aa15.42■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 AK9Q5TCS8 1911 aa15.41■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 ALPK3Q96L96 1907 aa15.41■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 CTGFP29279 349 aa15.41■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 MFSD14BQ5SR56 506 aa15.41■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 CHMP3Q9Y3E7 222 aa15.41■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 SPDYE5A6NIY4 337 aa15.4■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 BTBD19C9JJ37 291 aa15.4■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 PLIN1O60240 522 aa15.4■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 KIF22Q14807 665 aa15.4■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 SLC17A8Q8NDX2 589 aa15.4■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 CHMP4AQ9BY43 222 aa15.4■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa15.4■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 FAM205AQ6ZU69 1335 aa15.4■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 A0A0C4DFX4 3053 aa15.4■□□□□ 0.06
AC008969.1-204ENST00000546956 FOXO4P98177 505 aa15.39■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 PRO3102Q9H379 93 aa15.39■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 MYH16Q9H6N6 1097 aa15.39■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 SERPINA10Q9UK55 444 aa15.39■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 IRF6O14896 467 aa15.38■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 CETPP11597 493 aa15.38■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 CRKP46108 304 aa15.38■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 CACNB3P54284 484 aa15.38■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 FLIIQ13045 1269 aa15.38■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 GRIK5Q16478 980 aa15.38■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 DNAAF4Q8WXU2 420 aa15.38■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 CPA4Q9UI42 421 aa15.38■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 MYH13Q9UKX3 1938 aa15.37■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 GNRH1P01148 92 aa15.37■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 GYG1P46976 350 aa15.37■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 TNNI2P48788 182 aa15.37■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa15.37■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 ERO1BQ86YB8 467 aa15.37■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 LINS1Q8NG48 757 aa15.37■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 TRIM47Q96LD4 638 aa15.37■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 WRNIP1Q96S55 665 aa15.37■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 SRRDQ9UH36 339 aa15.37■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 DOCK3Q8IZD9 2030 aa15.37■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 PSMC4P43686 418 aa15.36■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 PRMT2P55345 433 aa15.36■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 SNAPC2Q13487 334 aa15.36■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 EPHA10Q5JZY3 1008 aa15.36■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 C17orf99Q6UX52 265 aa15.36■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 CCL5P13501 91 aa15.35■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 OSBPP22059 807 aa15.35■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 GRK4P32298 578 aa15.35■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 GJA8P48165 433 aa15.35■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 PPIL2Q13356 520 aa15.35■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 LMBR1LQ6UX01 489 aa15.35■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa15.35■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 RAET1EQ8TD07 263 aa15.35■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 HTATIP2Q9BUP3 242 aa15.35■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 CNNM1Q9NRU3 951 aa15.35■□□□□ 0.05
AC008969.1-204ENST00000546956 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms