RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546279.5

LMO3-233, Transcript of LIM domain only 3, human

TSL 4

Gene LMO3, Length 590 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMO3-233	ENST00000546279	SCARF1	Q14162	830 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	CCDC102B	Q68D86	513 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	PODN	Q7Z5L7	613 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	GML	Q99445	158 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	APBB1	O00213	710 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	KCNJ4	P48050	445 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	SOX10	P56693	466 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	NUCB1	Q02818	461 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	DACT2	Q5SW24	774 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	CERS5	Q8N5B7	392 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	PSMD14	O00487	310 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	RASGRF1	Q13972	1273 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	GRIK5	Q16478	980 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	AACS	Q86V21	672 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	AK9	Q5TCS8	1911 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LMO3-233	ENST00000546279	RAD17	O75943	681 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	PDE4A	P27815	886 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	MCAM	P43121	646 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	PI16	Q6UXB8	463 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	CCDC102A	Q96A19	550 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	MXD3	Q9BW11	206 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		13.08	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	HUNK	P57058	714 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	ZNF384	Q8TF68	577 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	SHTN1	A0MZ66	631 aa		13.06	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	USP17L3	A6NCW0	530 aa		13.06	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	USP17L4	A6NCW7	530 aa		13.06	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	SEMA3E	O15041	775 aa		13.06	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	NEFL	P07196	543 aa		13.06	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	TNIP1	Q15025	636 aa		13.06	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		13.06	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		13.06	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		13.06	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		13.06	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	STAP2	Q9UGK3	403 aa		13.06	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		13.06	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	GTF2I	P78347	998 aa		13.05	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		13.05	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	RGMB	Q6NW40	437 aa		13.05	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	13.05	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	LNPK	Q9C0E8	428 aa		13.05	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		13.05	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	JAG2	Q9Y219	1238 aa		13.05	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	ATP5J	P18859	108 aa		13.04	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		13.04	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		13.04	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		13.04	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		13.04	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		13.04	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279		H7C1D1	291 aa		13.03	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		13.03	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		13.03	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.03	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	SPATA5	Q8NB90	893 aa		13.03	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		13.03	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	DPF2	Q92785	391 aa		13.03	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.03	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	RNF186	Q9NXI6	227 aa		13.03	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		13.03	□□□□□ -0.32
LMO3-233	ENST00000546279	TRPA1	O75762	1119 aa		13.02	□□□□□ -0.33
LMO3-233	ENST00000546279	EGFR	P00533	1210 aa		13.02	□□□□□ -0.33
LMO3-233	ENST00000546279	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
LMO3-233	ENST00000546279	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
LMO3-233	ENST00000546279	ZAP70	P43403	619 aa		13.02	□□□□□ -0.33

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